[发明专利]酪氨酸蛋白激酶JAK2基因中与猪抗蓝耳病相关的SNP标记及其应用有效
申请号: | 201310082138.6 | 申请日: | 2013-03-14 |
公开(公告)号: | CN104046621A | 公开(公告)日: | 2014-09-17 |
发明(设计)人: | 李宁;陈志胜;任立明;胡晓湘 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;张庆敏 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 酪氨酸 蛋白激酶 jak2 基因 猪抗蓝耳病 相关 snp 标记 及其 应用 | ||
1.一种与猪抗蓝耳病相关的SNP标记,其特征在于,其位于猪的酪氨酸蛋白激酶JAK2基因上,所述SNP标记的核苷酸序列如SEQID NO.1所示,其中,该序列的81bp、115bp、151bp和264bp四处碱基分别为T、A、G和A的待测猪为易感蓝耳病猪品种,而这四处碱基分别为C、G、A和T的待测猪为抗蓝耳病猪品种。
2.用于检测权利要求1所述与猪抗蓝耳病相关的SNP标记的引物对,其特征在于,包括上游引物F:5’-AAGCATGATGAGCCAGCTTT-3’和下游引物R:5'-CCACTTCCCCAGTGTTGTCT-3'。
3.权利要求1所述与猪抗蓝耳病相关的SNP标记在鉴定抗蓝耳病猪品种中的应用,其包括步骤:
1)提取待测猪样品组织中的总RNA,反转录成cDNA;
2)以步骤1)中的cDNA为模板,F和R为引物,进行RT-PCR反应;
3)分析PCR产物,如果扩增产物序列中81bp、115bp、151bp和264bp四处的碱基分别为C、G、A和T,则待测猪为抗蓝耳病猪品种。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,步骤2)中反转录PCR包括的步骤为:
i)打开RNA二级结构
在一支无核酸酶污染的离心管中加入:
ii)反转录PCR
向上述离心管中加入:
反转录PCR的反应条件为:42℃,60min。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,步骤2)中常规PCR使用的扩增体系以15μl计为:
6.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,步骤2)中常规PCR的反应条件为:95℃ 5min;以95℃ 30s,50℃-70℃,30s-2min;72℃ 30s-2min做35个循环;72℃ 10min,于4℃保温。
7.含有权利要求2所述引物对的用于检测抗蓝耳病猪品种的试剂盒。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg2+、PCR反应缓冲液中的一种或多种。
9.根据权利要求7或8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括标准阳性模板。
10.权利要求1所述与猪抗蓝耳病相关的SNP标记在猪的分子标记辅助育种中的应用。
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