[发明专利]一种设计碱基替换或插入缺失的SNP分子标记的方法

权利要求书

1.一种设计碱基替换或插入缺失的SNP分子标记的方法，其特征在于，该方法以已知功能基因SNP突变位点为参照，将此位点设计在特异引物的3′位置；通过分别设计Allele1和Allele2特异位点两对引物，通过两次PCR，再通过技术检测PCR结果，确定出个体SNP位点的基因型，通过标记功能验证及稳定性检测，将该分子标记用于辅助选择育种。

2.如权利要求1所述的设计碱基替换或插入缺失的SNP分子标记的方法，其特征在于，该方法引物设计方法为：

两个个体相同的基因处有一个T碱基和C碱基的替换，由Allele1特异位点T设计特异引物P1，同样由Allele2特异位点C设计特异引物P2；两对引物在Genotype1中扩增时，P1引物能够正常扩增出PCR产物，P2引物不能正常扩增而没有PCR产物，确定该基因的基因型为TT；用相同的方法扩增可以确定Genotype2基因型为CC；若两者都能得到扩增产物，可确定Genotype3基因型为TC，从而分析出SNP位点。