[发明专利]用于检测人乳头瘤病毒并提供头颈部鳞状细胞癌预后的方法

说明书

相关申请的交叉引用

本专利申请要求2011年11月15日提交的美国临时专利申请第61/559,974号以及2012年6月1日提交的美国临时专利申请第61/654,595号的优先权权益，它们各自整体以引用方式并入本文。

政府支持确认

本发明根据国立卫生研究院的第R01CA118584-NIH号资助在政府支持下完成。政府享有本发明的某些权利。

技术领域

本文所公开的主题一般涉及用于头颈部鳞状细胞癌的检测、治疗和预后的方法和试剂盒。

发明背景

头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)每年在美国影响着50,000人并在全世界影响着600,000人。主要风险因素包括吸烟和饮酒以及人乳头瘤病毒(HPV)感染。

迄今为止，尚无得到广泛接受的HNSCC筛查方案或检验(参见例如Vokes等人,N Engl J Med,328:184-94(1993)；Lingen等人,Curr Opin Oncol,13:176-82(2001)；Forastiere等人,N Engl J Med345:1890-1900(2001)；Patton,Orol Oncol,39:708-723(2003)；O’Hara等人,Clin Otolaryngol,27:133-4(2002)；Smart,Cancer72:1061-5(1993)；Sankaranarayanan等人,Cancer,88:664-73(2000)；Sankaranarayanan等人,Lancet365:1927-33(2005))，原因是金标准(通过体检筛查然后进行活组织检查)具有有限的灵敏性和特异性(分别为64％和74％)(Brocklehurst等人,Cochrane Database Syst Rev,11:CD004150(2010))并且分子诊断测试仍在开发中(Nagler,Oral Oncol.,45:1006-10(2009)；Mahfouz等人,Eur Arch Otorhinolaryngol,267:851-60(2010))。使用染料、自体荧光或脱落细胞学的检测口腔癌的辅助技术是可用的，但是最近的评论提出了它们是否改善早期检出率的疑问(Patton等人,J Am Dent Assoc,139:896-905(2008)；Lingen等人,Oral Oncol44:10-22(2008))。因此，努力已集中于分子诊断工具。测试唾液的RNA表达谱的多项研究(Li等人,Clin Cancer Res,10:8442-8450(2004))、微RNA发现(Park等人,Clin Cancer Res,15:5473-5477(2009))和蛋白质组学分析(Hu等人,Clin Cancer Res,14:6246-6252(2008))显示出前景，但是有些复杂并且未得到验证(Nagler,Oral Oncol.,45:1006-10(2009)；Mahfouz等人,Eur Arch Otorhinolaryngol,267:851-60(2010))。因此，大部分患者在晚期才被诊断，此时治愈率为40％或更低。因此，需要早期检测测试。

发明概要

根据在本文具体体现并广泛描述的所公开的材料、化合物、组合物和方法的目的，所公开的主题在一个方面涉及用于头颈部鳞状细胞癌检测、治疗及提供其预后的方法和试剂盒。

另外的优点将在下文的描述中部分地示出，并部分地将通过该描述显而易见，或可通过实践下述方面得以了解。下述优点将通过在所附权利要求书中具体指出的要素和组合而实现和得到。应当理解，前文一般性描述和下文详细描述均仅仅为示例性和阐释性的，而非限制性的。

附图简述

图1A至1B是示出了研究中的患者的无进展生存率(PFS)(图1A)和总生存率(OS)(图1B)的图。图1C是示出了在12、24和36个月的中位PFS、PFS率和OS的表格。图1D是示出了总、中位、最小、最大、平均OS和PFS以及标准偏差的表格。