[发明专利]纤维变性易感性IL22RA2基因及其用途有效
申请号: | 201280047401.1 | 申请日: | 2012-08-03 |
公开(公告)号: | CN104302780B | 公开(公告)日: | 2017-04-12 |
发明(设计)人: | 阿莱恩·德赛因;马蒂厄·塞尔托里奥;劳伦特·阿尔吉罗 | 申请(专利权)人: | 艾克斯-马赛大学;法国国家卫生及研究医学协会 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司11219 | 代理人: | 张颖,谢丽娜 |
地址: | 法国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 纤维 变性 感性 il22ra2 基因 及其 用途 | ||
1.对象中发生细胞外基质蛋白(ECMP)的异常沉积的易感性检测或诊断和/或预后的体外方法,所述方法包括检测所述对象的生物样品中IL22RA2基因座中变化的存在。
2.权利要求1的方法,其用于纤维变性的易感性检测或诊断和/或预后。
3.权利要求2的方法,其用于评估纤维变性的进展。
4.权利要求1至3任一项的方法,其中所述变化位于IL22RA2基因的起始密码子上游的500kb之内,优选地100kb之内,优选地20kb之内,更优选地10kb之内,并位于IL22RA2基因的3’UTR下游的500kb之内,优选地100kb之内,优选地20kb之内,更优选地10kb之内。
5.权利要求1至4任一项的方法,其中所述变化是一个或多个碱基的突变、插入或缺失。
6.权利要求5的方法,其中所述变化是一个或数个单核苷酸多态性(SNP)。
7.权利要求6的方法,其中所述SNP选自rs6570136、rs7774663、rs11154915和rs2064501。
8.权利要求7的方法,其包括对对象的生物样品中IL22RA2基因座中的SNP进行基因分型,其中在SNP rs6570136中存在基因型GG,在SNP rs7774663中存在基因型TT,在SNP rs11154915中存在基因型TT、CT和/或在SNP rs2064501中存在基因型CC,指示了在所述对象中发生细胞外基质蛋白(ECMP)的异常沉积或纤维变性的风险,或指示了细胞外基质蛋白(ECMP)的异常沉积或纤维变性的发生,或指示了纤维变性的不良预后。
9.权利要求2至8任一项的方法,其中所述纤维变性发生在选自肝纤维变性、肝硬化、皮肤瘢痕瘤、增生性瘢痕、硬皮病和肥胖症的人类纤维变性疾病中。
10.权利要求9的方法,其中所述肝纤维变性由甲肝病毒、乙肝病毒、丙肝病毒、日本血吸虫或曼森氏血吸虫感染引起。
11.权利要求1至10任一项的方法,其中所述IL22RA2基因座中变化的存在,通过测序、选择性杂交和/或选择性扩增来检测。
12.权利要求1至10任一项的方法,其中SNP的存在通过限制性酶消化来检测,检测到至少一个所述SNP是细胞外基质蛋白(ECMP)的异常沉积或纤维变性的指示。
13.一种为对象选择治疗性化合物的方法,所述对象患有或易于发生细胞外基质蛋白(ECMP)的异常沉积或纤维变性,所述方法包括将测试化合物与IL22RA2多肽或基因或其片段相接触,并确定所述测试化合物提高或降低与IL22RA2基因座相关的途径的生物活性或功能的能力。
14.一种用于确定患有病毒感染的患者对使用抗病毒剂和/或干扰素的治疗做出响应的可能性的体外方法,所述方法包括确定所述患者的生物样品中IL22RA2基因座中、或IL22RA2表达或IL22RA2蛋白活性中的变化。
15.权利要求14的方法,其中所述变化位于IL22RA2基因的起始密码子上游的500kb之内,优选地100kb之内,优选地20kb之内,更优选地10kb之内,并位于IL22RA2基因的3’UTR下游的500kb之内,优选地100kb之内,优选地20kb之内,更优选地10kb之内。
16.权利要求14或15任一项的方法,其中所述变化是一个或多个碱基的突变、插入或缺失。
17.权利要求16的方法,其中所述变化是一个或数个单核苷酸多态性(SNP)。
18.权利要求17的方法,其中所述SNP选自rs11154915、rs6570136、rs2064501和rs1543509。
19.权利要求19的方法,其包括对对象的生物样品中IL22RA2基因座中的SNP进行基因分型,其中对于SNP rs11154915来说TT基因型、对于SNP rs6570136来说AG或GG基因型、对于SNP rs2064501来说CT基因型和/或对于SNP rs1543509来说AA基因型的存在,有利于患者对所述治疗的阳性响应。
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