[发明专利]用于检测HPV核酸的材料和方法

权利要求书

1.一种分离的核酸，其具有不超过200个核苷酸的总体长度且包含至少一种与选自下组的核苷酸序列具有至少75%同源性的核苷酸序列：SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:105和SEQ ID NO:111至SEQ ID NO:308、其RNA等同物及其互补物。

2.权利要求1的分离的核酸探针，其具有不超过100个核苷酸的总体长度。

3.权利要求1的分离的核酸，其具有不超过50个核苷酸的总体长度。

4.依照权利要求1的分离的核酸，其由选自下组的核苷酸序列组成：SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:105和SEQ ID NO:111至SEQ ID NO:308、其RNA等同物及其互补物。

5.权利要求1-4中任一项的分离的核酸，其中所述核酸能够在严格条件下与下列各项杂交：

(a)人乳头瘤病毒(HPV)基因组中选自由HPV16和HPV18组成的组的部分，

(b)源自所述HPV基因组的mRNA转录物，或

(c)所述mRNA的互补物。

6.权利要求1-5的分离的核酸，其中所述核酸能够在高严格性条件下与下列各项杂交：

(a)人乳头瘤病毒(HPV)基因组中选自由HPV16和HPV18组成的组的部分，

(b)源自所述HPV基因组的mRNA转录物，或

(c)所述mRNA的互补物。

7.权利要求1-6中任一项的分离的核酸，其中所述核酸不能在严格条件下与超过一类人乳头瘤病毒(HPV)基因组杂交。

8.权利要求1-7中任一项的分离的核酸，其能够在严格条件下与选自下组的HPV16或HPV18基因和/或mRNA杂交：E2和E6/E7。

9.权利要求1-8中任一项的分离的核酸，该分离的核酸在其整个长度间与HPV16或HPV18基因中选自下组的部分具有至少75%同源性：E2和E6/E7。

10.一种核酸探针，其包含依照权利要求1-9中任一项的分离的核酸，且任选地进一步包含可检测标记物和/或配体。

11.权利要求10的核酸探针，其中所述核酸探针与固体支持物结合。

12.一种探针组，其包含依照权利要求10或权利要求11的至少一种核酸探针。

13.一种检测靶RNA存在的方法，该方法包括：

a)提供至少一种DNA捕捉探针，其中所述至少一种DNA捕捉探针与支持物结合；

b)使所述靶RNA与所述至少一种DNA捕捉探针杂交，生成靶RNA:DNA捕捉探针复合物；

c)分离所述靶RNA:DNA捕捉探针复合物；

d)提供至少一种DNA放大探针，并使所述至少一种DNA放大探针与所述靶RNA:DNA捕捉探针复合物杂交，生成靶RNA:DNA捕捉/放大探针复合物；

e)提供抗RNA:DNA杂合物抗体，并将所述靶RNA:DNA捕捉/放大探针复合物与所述抗体一起温育，生成靶RNA:DNA:抗体复合物；

f)检出所述抗体，其中所述检出指示所述靶RNA的存在，

其中所述捕捉探针和/或放大探针包含依照权利要求1-9中任一项的分离的核酸。

14.权利要求13的方法，其中所述靶RNA是剪接变体，且其中选择所述至少一种DNA捕捉探针和所述至少一种DNA放大探针以检测所述剪接变体的存在。