[发明专利]多级PCR检测HPV的方法和试剂盒有效

专利信息
申请号: 201210564287.1 申请日: 2012-12-21
公开(公告)号: CN103882148B 公开(公告)日: 2019-01-04
发明(设计)人: 洪国藩;李善衡 申请(专利权)人: 中国科学院上海生命科学研究院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686;C12M1/00
代理公司: 上海一平知识产权代理有限公司 31266 代理人: 祝莲君;崔佳佳
地址: 200031 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 多级 pcr 检测 hpv 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种非诊断且非治疗性的鉴别人乳头瘤病毒HPV型别的方法,其特征在于,包括步骤:

(a)在封闭的第一级PCR反应腔或隔室中,以HPV基因组DNA为模板,通过HPV特异性的第一引物对进行扩增,从而获得第一扩增产物P1;

(b)将第一扩增产物从第一级PCR隔室转移至第二级PCR隔室中,作为第二级PCR的模板,并在封闭的第二级PCR隔室中,通过HPV特异性的第二引物对进行扩增,从而获得第二扩增产物P2;

(c)任选地,将上一步骤的扩增产物Pi从第i级PCR隔室转移至第i+1级PCR隔室中,作为第i+1级PCR的模板,并在封闭的第i+1级PCR隔室中,通过HPV特异性的第i+1引物对进行扩增,从而获得第i+1扩增产物Pi+1,其中i为≥2的正整数;本步骤可进行一次或多次;

(d)对上一步骤中获得的所述第二扩增产物P2或所述第i+1扩增产物Pi+1,进行测序,从而获得HPV的序列;和

(e)将测得的HPV序列与HPV标准序列进行比对,从而鉴别出HPV的型别;

且在步骤(a)中,第一级PCR隔室中放置有可携带PCR扩增产物的固体颗粒,从而在PCR反应过程中或之后,形成携带PCR扩增产物的固体颗粒;并且所述的固体颗粒是磁性微球;

且所述的方法还包括:在步骤(b)和(c)中,利用磁铁或电磁铁,通过所述携带PCR扩增产物的固体颗粒,将第j扩增产物Pj从第j级PCR隔室转移至第j+1级PCR隔室,其中j为≥1的正整数;

并且在步骤(a)、(b)和(c)的整个过程中,所有的PCR隔室都处于封闭状态;

在步骤(b)和(c)中,将第j扩增产物Pj从第j级PCR隔室转移至第j+1级PCR隔室过程中,第j级PCR隔室和第j+1级PCR隔室都处于完全封闭状态,其中j为≥1的正整数,并且在第j级PCR隔室和第j+1级PCR隔室之间设有完全封闭的或可完全封闭的连接通道,所述连接通道用于让携带PCR扩增产物的固体颗粒从Pj级隔室或上游隔室转移至Pj+1级隔室或下游隔室;

且所述的方法在多级PCR反应管中进行,所述的多级PCR反应管的隔室之间设有封闭的或可封闭的连接通道(40),所述连接通道用于让携带PCR扩增产物的固体颗粒(50)从通过一个隔室转移至另一隔室;

且所述的隔室具有腔盖(20),并且对于相互连通的多个隔室而言,当各自的腔盖全部盖上后,就构成一个封闭空间。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的隔室呈矩阵排列,所述矩阵为a×b矩阵,其中a为2-100的正整数,b为2-100的正整数。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述连接通道位于反应腔或隔室上部;

并且当所述上游隔室盖上腔盖后,所述连接通道在上游隔室的入口隔室上部,并且位于腔盖下沿下方,从而使得携带PCR扩增产物的固体颗粒被抬升从而离开位于隔室下方的反应体系后,进入所述入口,经过连接通道,再通过所述连接通道在下游隔室的出口,进入下游隔室。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的第一引物对选自下组:简并引物MY09/11及其改进型PGMY09/11;SPF1/2。

5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的第二引物对选自下组:

MY11/GP6;PGMY11/GP6;MY11/GP6+;PGMY11/GP6+;

MY09/GP5;PGMY09/GP5;MY09/GP5+;PGMY09/GP5+;和/或

当i=2时,步骤(c)中使用第三引物对进行扩增,且所述的第三引物对选自下组:通用引物GP5和GP6;GP5+和GP6+。

6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,在步骤(d)中,将GP5、GP6、GP5+和/或GP6+作为通用引物,进行测序。

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