[发明专利]一种验证二硫键对木聚糖酶热稳定性影响的方法无效
申请号: | 201210562636.6 | 申请日: | 2012-12-24 |
公开(公告)号: | CN102978224A | 公开(公告)日: | 2013-03-20 |
发明(设计)人: | 邬敏辰;余涛;殷欣;李剑芳 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | C12N15/56 | 分类号: | C12N15/56;C12N9/42;C12N15/81;C12N1/19;C12R1/84 |
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地址: | 214122 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 验证 二硫键 聚糖 热稳定性 影响 方法 | ||
1.一种对来源于米曲霉Aspergillus oryzae的11家族的杂合木聚糖酶AEx11A进行耐热分析。通过对AEx11A结构的同源建模及其与AoXyn11A结构的比对分析,定向突变以研究热稳定提高的原因,突变后的核苷酸(AEx11AC5T)序列为SEQ ID NO:1。
2.由权利要求1所述的突变的木聚糖酶基因(AEx11AC5T)编码的突变木聚糖酶(AEx11AC5T),其完整的氨基酸序列对应于序列表中的为SEQ ID NO:2。
3.AEx11A结构的同源建模及其与AoXyn11A结构的比对分析:
同源建模AEx11A的空间结构:登录蛋白质结构数据库Protein data bank(http://rcsb.org),经BLAST比对,找到与AEx11A一级结构具有高度同源的,分别来自绳状青霉菌Penicilliumfuniculosum(1TE1)、E.coli(2VUL)和红褐肉座菌Hypocrea jecorina(1ENX)的11家族木聚糖酶晶体结构,作为同源建模的模板;其相似性分别为63.7%、78.8%和60.9%。利用SALIGN(http://salilab.org/DBAli/?page=tools_&action=f_salign)和MODELLER 9.9(http://salilab.org/modeller/)程序对AEx 11A进行同源建模;
经比对发现由于N端替换,在AEx11A分子结构中引入了一个二硫键(Cys5-Cys32),其连接两个反向平行的β-折叠股(A1和A2),可能会通过降低蛋白质解折叠状态的熵,而对其热稳定性提高有一定的作用。
4.突变木聚糖酶工程菌的构建和表达方法:
(1)突变基因AEx11AC5T及表达质粒的构建
根据pPIC9K-AEx11A(本实验是保存)设计引物,将其中的Cys5突变为Thr5
F1:5′-GA ATTCAACGCTCAAACTactCTTACCTCT-3′,含EcoR I酶切位点和突变点Thr5
R1:5′-GCGGCCGCTCAATAAACAGTGATAATAGCAG-3′,含Not I酶切位点
以pPIC9K-AEx11A为模板,以F1和R1为引物进行PCR反应。94℃2min;30个循环,94℃30s,55℃30s,72℃40s;72℃10min。将PCR的目的条带进行克隆、测序;测序正确的pUCm-T-AEx11AC5T与pPIC9K质粒均用EcoR I和Not I进行双酶切,回收的酶切产物在T4DNA连接酶的作用下进行连接,得到重组质粒pPIC9K-AEx11AC5T,并对重组质粒进行测序鉴定;
(2)GS115/AEx11AC5T的构建、表达、产物纯化及活性测定
用Sal I对pPIC9K-AEx11AC5T进行线性化,按照毕赤酵母表达手册进行电转化、筛选,得到高拷贝的毕赤酵母重组子GS115/AEx11AC5T;该工程菌用1.0%甲醇诱导72h,DNS法测得发酵液中突变木聚糖酶活性与原酶AEx11A基本一致。发酵液经离心后的上清液为突变AEx11AC5T粗酶液,经截留分子量为10kDa的超滤膜浓缩,再经DEAE-Sepharose Fast Flow离子交换层析和Sephadex G-75凝胶过滤层析纯化,纯化后经SDS-PAGE检测为单一条带,并显示突变木聚糖酶分子量与原酶AEx11A基本一致;该突变木聚糖酶最适作用温度60℃,低于原酶AEx11A的最适温度85℃;其t1/270和t1/280分别为3.0、1.0min低于原酶AEx11A的197和25min。
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