[发明专利]一种检测茶树ICE1基因表达特性的新型荧光定量PCR法无效
申请号: | 201210537186.5 | 申请日: | 2012-12-13 |
公开(公告)号: | CN103255205A | 公开(公告)日: | 2013-08-21 |
发明(设计)人: | 丁兆堂;时慧;王玉;胡建辉 | 申请(专利权)人: | 青岛农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
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地址: | 266000 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 茶树 ice1 基因 表达 特性 新型 荧光 定量 pcr | ||
1.一种检测茶树ICE1基因表达特性的新型荧光定量PCR法的不同处理条件,其特征包括:低温处理(4℃、-5℃)、激素处理(AB、BR)、干旱处理。
2.一种检测茶树ICE7基因表达特性的新型荧光定量PCR法的不同处理条件下的取样时间,其特征包括0min-72h。
3.一种检测茶树ICE7基因表达特性的新型荧光定量PCR法的特异性引物,其特征包括符合荧光定量PCR反应特点的上下游引物:
ICE1-F:5「′-GGAGAACCTTGGGCTAGACAT-3′,
ICE1-R:5「′-TCTATAGGCATGAGAAAGAGCA-3′;
以及作为内参基因的上下游引物:GAPDH-F:5′-TTGGCATCGTTGAGGGTCTC-3′,GAPDH-R:5′-CATCGACAGTGGGAACACGG-3′。
4.一种采用权利要求3所述特异性引物检测权利1和2要求的茶树ICE1基因表达的特性的方法,其特征在于按如下步骤:
(1)cDNA第一链的合成:提取样本的总RNA并纯化,采用反转录试剂盒得到以提取的RNA为模板反转录得到cDNA;
(2)对下述引物进行常规PCR检测
该基因的荧光定量上下游引物:
ICE1-F:5「′-GGAGAACCTTGGGCTAGACAT-3′,
ICE1-R:5「′-TCTATAGGCATGAGAAAGAGCA-3′
以及作为内参基因的上下游引物
GAPDH-F:5′-TTGGCATCGTTGAGGGTCTC-3′
GAPDH-R:5′-CATCGACAGTGGGAACACGG-3′
常规PCR扩增体系如下:
常规PCR反应程序如下:
(3)实时荧光定量反应:
以步骤(1)得到的cDNA为模板,加入步骤(2)所述的引物,进行荧光定量PCR程序、溶解曲线程序和冷却程序反应,每个样品设置≥3个平行,扩增后取平均值。
实时荧光定量PCR扩增体系如下;
实时荧光定量PCR反应程序如下:
溶解曲线反应程序为:
95℃5s
65℃1min
冷却反应程序为:
40℃30s。
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