[发明专利]一种检测茶树ICE1基因表达特性的新型荧光定量PCR法无效

专利信息
申请号: 201210537186.5 申请日: 2012-12-13
公开(公告)号: CN103255205A 公开(公告)日: 2013-08-21
发明(设计)人: 丁兆堂;时慧;王玉;胡建辉 申请(专利权)人: 青岛农业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266000 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 茶树 ice1 基因 表达 特性 新型 荧光 定量 pcr
【权利要求书】:

1.一种检测茶树ICE1基因表达特性的新型荧光定量PCR法的不同处理条件,其特征包括:低温处理(4℃、-5℃)、激素处理(AB、BR)、干旱处理。

2.一种检测茶树ICE7基因表达特性的新型荧光定量PCR法的不同处理条件下的取样时间,其特征包括0min-72h。

3.一种检测茶树ICE7基因表达特性的新型荧光定量PCR法的特异性引物,其特征包括符合荧光定量PCR反应特点的上下游引物:

ICE1-F:5「′-GGAGAACCTTGGGCTAGACAT-3′,

ICE1-R:5「′-TCTATAGGCATGAGAAAGAGCA-3′;

以及作为内参基因的上下游引物:GAPDH-F:5′-TTGGCATCGTTGAGGGTCTC-3′,GAPDH-R:5′-CATCGACAGTGGGAACACGG-3′。

4.一种采用权利要求3所述特异性引物检测权利1和2要求的茶树ICE1基因表达的特性的方法,其特征在于按如下步骤:

(1)cDNA第一链的合成:提取样本的总RNA并纯化,采用反转录试剂盒得到以提取的RNA为模板反转录得到cDNA;

(2)对下述引物进行常规PCR检测

该基因的荧光定量上下游引物:

ICE1-F:5「′-GGAGAACCTTGGGCTAGACAT-3′,

ICE1-R:5「′-TCTATAGGCATGAGAAAGAGCA-3′

以及作为内参基因的上下游引物

GAPDH-F:5′-TTGGCATCGTTGAGGGTCTC-3′

GAPDH-R:5′-CATCGACAGTGGGAACACGG-3′

常规PCR扩增体系如下:

 Components   Vblume(μl)  Master Mix   12.5  Forward Primer   2  Reverse Primer   2  cDNA   2  Water   6.5  Total Vblume(μl)   25

常规PCR反应程序如下:

(3)实时荧光定量反应:

以步骤(1)得到的cDNA为模板,加入步骤(2)所述的引物,进行荧光定量PCR程序、溶解曲线程序和冷却程序反应,每个样品设置≥3个平行,扩增后取平均值。

实时荧光定量PCR扩增体系如下;

  Components  Volume(μl)   SYBR Green qPCR Master Mix   10   Forward Primer   0.8   Reverse Primer   0.8   cDNA   2   Water   6.4   Total Volume(μl)   20

实时荧光定量PCR反应程序如下:

溶解曲线反应程序为:

95℃5s

65℃1min

冷却反应程序为:

40℃30s。 

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