[发明专利]一种与前列腺癌易感性相关的单核苷酸多态性位点及其应用

权利要求书

1.一种与前列腺癌易感性相关的遗传区域19q13.4上的基因序列，其特征在于，核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示，其第501位为T/C。

2.根据权利要求1所述的与前列腺癌易感性相关的遗传区域19q13.4上的基因序列，其特征在于，所述的与前列腺癌易感性相关的遗传区域19q13.4上具有一单核苷多态性位点rs103294，rs103294位于LILRA3基因附近；rs103294碱基为T/C；rs103294的SNP序列如SEQ.ID.NO.2所示。

3.一种检测一单核苷酸多态性位点rs103294的特异性核酸引物，其特征在于序列为：SEQ.ID.NO.3，SEQ.ID.NO.4，SEQ.ID.NO.5，其特异性地扩增出单核苷酸多态性位点的扩增产物。

4.从权利要求2所述的与前列腺癌易感性相关的遗传区域19q13.4基因序列，获得rs103294序列的方法，其特征在于具体步骤如下：

在遗传区域19q13.4上选择单核苷酸多态性位点rs103294；依据相应的碱基序列合成引物SEQ.ID.NO.3，SEQ.ID.NO.4以及UEP引物SEQ.ID.NO.5；进行PCR扩增，获取SNP rs103294分型数据。

5.从权利要求4所述的方法，其特征在于PCR反应体系5ul：0.625ul 10×TaqBuffer,0.1 25mM dNTP,0.12ul 10nM PCR引物Mix，0.325 25nM MgCl₂,0.1ul 5U/ML Hotstar酶, 用ddH₂O补足5ul；PCR反应条件：95℃ 2min；95℃ 0.5min，96℃ 0.5min，72℃ 1min，45个循环；72℃ 5min，25℃ ∞min；SAP纯化反应体系2ul：0.17ul 10×SAPBuffer,0.3 1U/ul SAP酶, 用ddH₂O补足2ul；SAP纯化反应条件：37℃ 40min，85℃ 5min，25℃∞min；单碱基延伸反应体系2ul:0.2 10×iPlexBuffer,0.2 iPlex Termination,0.33 100uM 终止引物Mix，0.041 iPlex Enzyme, 用ddH₂O补足2ul；单碱基延伸反应条件：94℃ 30s；94℃ 5s，92℃ 5s-80℃ 5s，内部循环5次，外部循环40次；72℃ 180s；25℃ ∞s；将反应产物共15nL，经树脂纯化后，SpectroCHIP芯片上样；通过MassARRAY? MALDI-TOF Mass Spectrometry 进行质谱检测，并获取SNP rs103294分型数据。

6.一种权利要求1所述的与前列腺癌易感性相关的遗传区域19q13.4基因序列的应用，其特征在于，通过提取受试者基因组DNA进行单核苷酸多态性位点rs103294的基因分型，其中rs103294碱基为C的个体为前列腺癌易感人群，rs103294碱基为Ｔ的个体为前列腺癌非易感人群。