[发明专利]用于基因定点修饰的TALE重复片段的高效合成方法有效

专利信息
申请号: 201210380206.2 申请日: 2012-09-29
公开(公告)号: CN102864158A 公开(公告)日: 2013-01-09
发明(设计)人: 魏文胜;杨君娇;袁鹏飞 申请(专利权)人: 北京大学
主分类号: C12N15/31 分类号: C12N15/31;C12N15/63;C12N15/85;C12N15/10;C12R1/64
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王朋飞;张庆敏
地址: 100871*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 用于 基因 定点 修饰 tale 重复 片段 高效 合成 方法
【权利要求书】:

1.用于合成TALE重复序列的连接单体,所述连接单体为编码TALE重复序列的DNA片段,所述DNA片段两端具有尿嘧啶酶切位点。

2.根据权利要求1所述的连接单体,其特征在于,根据密码子简并性,除RVDs以外,所述连接单体编码相同的氨基酸序列。

3.根据权利要求2所述的连接单体,其特征在于,所述连接单体经尿嘧啶酶切后,相邻两连接单体间具有唯一匹配的粘性末端。

4.根据权利要求1-3任一项所述的连接单体,其特征在于,其为以下引物的扩增产物:

下游引物任选SEQ ID NO 17-20、上游引物任选SEQ ID NO21-24,其中SEQ ID NO 17和SEQ ID NO 21引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 1-4任一所示;

或下游引物任选SEQ ID NO 25-28、上游引物任选SEQ IDNO.29-3,其中SEQ ID NO 25和SEQ ID NO 29引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 5-8任一所示;

或下游引物任选SEQ ID NO 33-36、上游引物任选SEQ ID NO37-40,其中SEQ ID NO 33和SEQ ID NO 37引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 9-12任一所示;

或下游引物任选SEQ ID NO 41-44、上游引物任选SEQ ID NO45-48,其中SEQ ID NO 41和SEQ ID NO 45引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 13-16任一所示。

5.由权利要求1-4任一项所述连接单体组装的二联体、三联体或多联体。

6.含有权利要求1-4任一项所述连接单体或权利要求5所述二联体、三联体或多联体的载体。

7.利用权利要求1-4任一项所述连接单体合成TALE重复片段的方法,其特征在于,包括如下步骤:

1)PCR扩增任意连接单体;

2)用尿嘧啶酶切试剂切割任意连接单体,再将切割的任意连接单体通过匹配的粘性末端相连;

3)重复采用步骤2)所述的酶切-连接的操作组装成含有任意重复单元、任意排列顺序的单体串联重复序列。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增条件为:Pfu Turbo Cx或Taq聚合酶,95°C变性30s;60°C退火20s;72°C延伸20s,30个循环。

9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,利用生物素-磁珠偶联的链霉亲和素进行DNA片段的连接。

10.权利要求1-4任一项所述连接单体、权利要求5所述三联体或权利要求6所述载体在基因敲除、基因敲入、过表达或抑制表达中的应用。

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