[发明专利]用于基因定点修饰的TALE重复片段的高效合成方法有效
| 申请号: | 201210380206.2 | 申请日: | 2012-09-29 |
| 公开(公告)号: | CN102864158A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
| 发明(设计)人: | 魏文胜;杨君娇;袁鹏飞 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
| 主分类号: | C12N15/31 | 分类号: | C12N15/31;C12N15/63;C12N15/85;C12N15/10;C12R1/64 |
| 代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;张庆敏 |
| 地址: | 100871*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 基因 定点 修饰 tale 重复 片段 高效 合成 方法 | ||
1.用于合成TALE重复序列的连接单体,所述连接单体为编码TALE重复序列的DNA片段,所述DNA片段两端具有尿嘧啶酶切位点。
2.根据权利要求1所述的连接单体,其特征在于,根据密码子简并性,除RVDs以外,所述连接单体编码相同的氨基酸序列。
3.根据权利要求2所述的连接单体,其特征在于,所述连接单体经尿嘧啶酶切后,相邻两连接单体间具有唯一匹配的粘性末端。
4.根据权利要求1-3任一项所述的连接单体,其特征在于,其为以下引物的扩增产物:
下游引物任选SEQ ID NO 17-20、上游引物任选SEQ ID NO21-24,其中SEQ ID NO 17和SEQ ID NO 21引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 1-4任一所示;
或下游引物任选SEQ ID NO 25-28、上游引物任选SEQ IDNO.29-3,其中SEQ ID NO 25和SEQ ID NO 29引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 5-8任一所示;
或下游引物任选SEQ ID NO 33-36、上游引物任选SEQ ID NO37-40,其中SEQ ID NO 33和SEQ ID NO 37引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 9-12任一所示;
或下游引物任选SEQ ID NO 41-44、上游引物任选SEQ ID NO45-48,其中SEQ ID NO 41和SEQ ID NO 45引物对除外;所述引物的DNA模板为SEQ ID NO 13-16任一所示。
5.由权利要求1-4任一项所述连接单体组装的二联体、三联体或多联体。
6.含有权利要求1-4任一项所述连接单体或权利要求5所述二联体、三联体或多联体的载体。
7.利用权利要求1-4任一项所述连接单体合成TALE重复片段的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)PCR扩增任意连接单体;
2)用尿嘧啶酶切试剂切割任意连接单体,再将切割的任意连接单体通过匹配的粘性末端相连;
3)重复采用步骤2)所述的酶切-连接的操作组装成含有任意重复单元、任意排列顺序的单体串联重复序列。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增条件为:Pfu Turbo Cx或Taq聚合酶,95°C变性30s;60°C退火20s;72°C延伸20s,30个循环。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,利用生物素-磁珠偶联的链霉亲和素进行DNA片段的连接。
10.权利要求1-4任一项所述连接单体、权利要求5所述三联体或权利要求6所述载体在基因敲除、基因敲入、过表达或抑制表达中的应用。
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