[发明专利]一种卵巢透明细胞癌诊断试剂盒及其制备方法无效
申请号: | 201210357881.3 | 申请日: | 2012-09-24 |
公开(公告)号: | CN102994630A | 公开(公告)日: | 2013-03-27 |
发明(设计)人: | 李明;何瑰;陈华云 | 申请(专利权)人: | 中山大学达安基因股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 510665 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 卵巢 透明 细胞 诊断 试剂盒 及其 制备 方法 | ||
1.一种辅助卵巢透明细胞癌诊断和治疗方案选择的HNF1B基因状态荧光原位杂交检测试剂盒,包括:1)杂交缓冲液、荧光标记探针混合物、未标记的竞争性DNA、DAPI复染剂,和2)分隔并集中包装这些试剂瓶或管的包装盒,其特征在于荧光标记探针混合物包含GSPHNF1B探针和17号染色体着丝粒探针,每人份荧光标记探针混合物中GSP HNF1B和CSP17探针的使用量均为0.5μl。
2.根据权利要求1的试剂盒,其特征还在于未标记的竞争性DNA为Human COT-1DNA。
3.根据权利要求1的试剂盒,其特征还在于杂交缓冲液的组分包括去离子甲酰胺,SSC,硫酸葡聚糖,其中去离子甲酰胺浓度为50%~70%,硫酸葡聚糖浓度为0.1g/ml。
4.根据权利要求1的试剂盒,其特征还在于DAPI复染剂配制方法为50~250ng DAPI溶于1ml抗褪色液(10mg/ml对苯二胺/PBS,甘油混合液)。
5.一种制备权利要求1试剂盒所述HNF1B基因探针和17号染色体着丝粒探针的方法,如下:
(1)片段筛选:通过NCBI Mapview数据库检索所有含有HNF1B基因的克隆,并对这些克隆进行筛选,选择含有HNF1B基因最优的克隆,编号为CTD-2257N17(chr17:36033624..36152533);通过NCBI Mapview数据库检索17号染色体重复区域序列,并进行重复性分析,选择引物设计区域;
(2)培养鉴定:按照HNF1B筛选确定的克隆编号购买克隆(Invitrogen),常规培养,使用针对HNF1B基因区域的STS引物进行PCR扩增,并通过2%琼脂糖凝胶电泳对扩增产物片段进行分析,从而完成待选HNF1B克隆的鉴定;CSP17以人基因组DNA为模板,利用设计的引物对进行PCR反应,通过电泳进行鉴定;将目的产物进行克隆、培养,从而完成待选CSP 17片段鉴定;
(3)探针制备:对鉴定阳性的菌液,进行质粒DNA的提取;通过OD值的测定对质粒DNA进行定量;然后,通过切口平移方法对质粒DNA进行荧光标记;对标记产物进行纯化;
(4)探针验证:使用人类正常分裂中期淋巴细胞滴片进行探针验证。
6.根据权利要求5所述的制备方法,其特征还在于包含HNF1B基因片段的克隆培养和鉴定步骤中使用的STS引物对序列分别为:上游引物5’-TGCACAGACTACAACCCTAAACC-3’和下游引物5’-TGTAGCACTGTTGTTCTTTGGG-3’;PCR扩增条件为:94℃5分钟;(94℃30秒,56℃30秒,72℃45秒)×35循环;72℃7分钟。
7.根据权利要求5所述的制备方法,其特征还在于制备CSP17探针的引物对序列为:
上游引物5’-TTGTAGAATCTGCGAAGGGAC-3’和下游引物5’-AGTGTTTCCAAACTGCTGAATC-3’;PCR扩增条件为:94℃5分钟;(94℃30秒,56℃30秒,72℃45秒)×35循环;72℃7分钟。
8.根据权利要求5所述的制备方法,其特征还在于探针制备过程中50μl切口平移体系中DNA聚合酶I使用量在10U~20U间,DNase I使用量在0.001U~0.01U间。
9.根据权利要求5所述的制备方法,其特征还在于探针标记的荧光素为荧光素标记Spectrum dUTP。
10.根据权利要求5所述的制备方法,其特征还在于探针浓缩方法为乙醇沉淀浓缩,最后使用1~2μl灭菌纯化水或Human Cot-1DNA(1μg/μl)溶解沉淀。
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