[发明专利]抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体及其制备与应用有效
| 申请号: | 201210349463.X | 申请日: | 2012-09-18 |
| 公开(公告)号: | CN102839180A | 公开(公告)日: | 2012-12-26 |
| 发明(设计)人: | 沈海燕;张建峰;郭鹏举;张春红;周恒;朱余军 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院兽医研究所 |
| 主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/85;C12N15/66 |
| 代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 裘晖;苏运贞 |
| 地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 抑制 p53 基因 表达 rna 干扰 载体 及其 制备 应用 | ||
1.一种干扰猪源p53基因的shRNA的转录模板,其特征在于:为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3退火杂交形成的双链DNA。
2.一种抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体,其特征在于:包括骨架载体、猪U6 RNA聚合酶Ⅲ启动子和权利要求1所述的干扰猪源p53基因的shRNA的转录模板。
3.根据权利要求2所述的抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体,其特征在于:
所述的骨架载体为pEGFP-C1载体;所述的pEGFP-C1载体的多克隆位点中的BamH Ⅰ和HindⅢ酶切位点进行了突变;
所述的猪U6RNA聚合酶Ⅲ启动子取代了pEGFP-C1载体的f1复制起点,在猪U6 RNA聚合酶Ⅲ启动子后接入了权利要求1所述的干扰猪源p53基因的shRNA的转录模板。
4.根据权利要求3所述的抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体,其特征在于:所述的BamH Ⅰ酶切位点由AAGCTT突变为AAGTTT,所述的HindⅢ酶切位点由GGATCC突变为GGAACC。
5.权利要求4所述的抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体的制备方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)突变pEGFP-C1载体多克隆位点中的BamH Ⅰ和HindⅢ酶切位点,得到BamH Ⅰ和HindⅢ酶切位点突变的重组载体pEGFP-C1-BH;
(2)PCR扩增得到如SEQ ID NO.4所示的Mlu Ⅰ酶切位点+TAT+Spe Ⅰ酶切位点+SV40复制起点序列+Stu Ⅰ酶切位点的DNA片段S;
(3)将步骤(2)得到的片段S和步骤(1)得到的重组载体pEGFP-C1-BH分别用Mlu Ⅰ和Stu Ⅰ酶切,将酶切后的片段连接得到重组载体pEGFP-C1-Spe Ⅰ;
(4)PCR扩增得到如SEQ ID NO.5所示的Spe Ⅰ酶切位点+猪U6 RNA聚合酶Ⅲ启动子序列+BamH Ⅰ酶切位点+ATA+Hind Ⅲ酶切位点+Mlu Ⅰ酶切位点的DNA片段U6;
(5)将步骤(4)得到的片段U6和步骤(3)得到的重组载体pEGFP-C1-SpeⅠ分别用Spe Ⅰ和Mlu Ⅰ酶切,将酶切后的片段连接得到重组载体pEGFP-C1-U6;
(6)将SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3退火杂交得到干扰猪源p53基因的shRNA的转录模板;
(7)将步骤(5)得到的重组载体pEGFP-C1-U6用BamH Ⅰ和HindⅢ酶切,酶切后的片段与步骤(6)得到的干扰猪源p53基因的shRNA的转录模板连接得到抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体。
6.根据权利要求5所述的抑制猪源p53基因表达的RNA干扰载体的制备方法,其特征在于:步骤(1)中所述的突变的方法为:
①以pEGFP-C1载体上1386-1646bp片段为靶片段,设计B1和B2引物突变掉BamH Ⅰ酶切位点,以pEGFP-C1载体为模板,PCR扩增得到靶片段B;
B1:5’-CCCCGGGAACCCGGATCTAGATAA-3’,
B2:5’-ACGCGTAGATACATTGATGAGTTTGGACAA-3’;
②将①中得到的靶片段B和pEGFP-C1载体分别用Sma Ⅰ和Mlu Ⅰ酶切,将酶切后的片段连接得到BamH Ⅰ酶切位点突变的重组载体pEGFP-C1-B;
③以pEGFP-C1载体上606-1357bp片段为靶片段,设计H1和H2引物突变掉HindⅢ酶切位点,以pEGFP-C1载体为模板,PCR扩增得到靶片段H;
H1:5’-CTAGCTAGCTACCGGTCGCCA-3’,
H2:5’-GGAATTCGAAGTTTTTGAGCTCGA-3’;
④将③中得到的靶片段H和②中得到的重组载体pEGFP-C1-B分别用Nhe Ⅰ和EcoR Ⅰ酶切,将酶切后的片段连接得到BamH Ⅰ和HindⅢ酶切位点突变的重组载体pEGFP-C1-BH。
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