[发明专利]SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法有效
| 申请号: | 201210348358.4 | 申请日: | 2012-09-18 |
| 公开(公告)号: | CN103667429A | 公开(公告)日: | 2014-03-26 |
| 发明(设计)人: | 胡晓湘;冯春刚;宋迟;顾晓荣;王彦强;李宁 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;A01K67/02 |
| 代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王朋飞;张庆敏 |
| 地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | snp 检测 筛选 性状 方法 | ||
1.SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)提取待测鸡DNA样品,用DNA特异性引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;
2)对PCR扩增产物中的鸡第3号染色体70486623bp位点进行单核苷酸多态性检测。
2.如权利要求1所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法,其特征在于,步骤1)所述的DNA特异性引物对的脱氧核糖核苷酸序列为:
上游引物:5’-Biotin-CGACTCTCAACGCGGGAAC-3’
下游引物:5’-CTGGGGGCAGCCATCTTG-3’
3.如权利要求1所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法,其特征在于,步骤1)所述的PCR扩增,其25μl反应体系终浓度为:
4.如权利要求1所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法,其特征在于,步骤1)所述的PCR扩增的反应条件为:94℃变性5min;94℃变性30sec,63℃退火30sec,65℃延伸1min,其中每扩增1个循环退火温度降低1℃,共10循环;94℃变性30sec,53℃退火30sec,65℃延伸1min,共30循环;65℃延伸7min;20℃保存;取2μl用于琼脂糖检测,扩增得到单一的目的条带后用于进一步检测。
5.如权利要求1所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法,其特征在于,步骤2)所述的单核苷酸多态性检测采用焦磷酸盐测序方法,为在PCR扩增产物中加入测序引物,放入PyroMarkID焦磷酸测序仪进行SNP检测。
6.如权利要求5所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法,其特征在于,所述的测序引物的脱氧核糖核苷酸序列为:
5’-GCGTCGCACACGGGC-3’
7.如权利要求5所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法,其特征在于,所述的焦磷酸盐测序方法具体为:
在步骤2)PCR扩增产物中加入Binding Buffer 38μl、Sepharoe Beads 2μl和灭菌水20μl,充分混匀10分钟,转移到反应板中,加入Annealing Buffer12μl,10μM测序引物1μl,放入PyroMarkID焦磷酸测序仪进行SNP检测,读取结果。
8.用于权利要求1所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法的试剂盒,包含脱氧核糖核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物。
9.权利要求1-7任一项所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法在鸡的育种中的应用。
10.权利要求9所述的SNP检测筛选鸡的丝羽性状的方法在鸡的育种中的应用,为在鸡分子标记辅助选择中的应用。
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