[发明专利]海洋鱼类线粒体12S rRNA基因扩增引物及其设计和扩增方法有效
| 申请号: | 201210314978.6 | 申请日: | 2012-08-30 |
| 公开(公告)号: | CN102912012A | 公开(公告)日: | 2013-02-06 |
| 发明(设计)人: | 徐田军;孙悦娜;王日昕;金逍逍 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋学院 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10 |
| 代理公司: | 杭州杭诚专利事务所有限公司 33109 | 代理人: | 尉伟敏 |
| 地址: | 316000 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 海洋 鱼类 线粒体 12 rrna 基因 扩增 引物 及其 设计 方法 | ||
1.海洋鱼类线粒体12S rRNA基因扩增引物,其特征是由两条单链寡核苷酸链组成,其中轻链引物为SEQ ID No.1所示的核苷酸序列;重链引物为SEQ ID No.2所示的核苷酸序列。
2.如权利要求1所述的海洋鱼类线粒体12S rRNA基因扩增引物,其特征是所述的海洋鱼类包括小黄鱼、眼斑拟石首鱼、白姑鱼、黄姑鱼、日本黄姑鱼、黑鳃梅橦鱼、棘头梅橦鱼、褐鯧鮋、尖头黄鳍牙、中华乌塘鳢、青弹涂鱼、斑纹舌虾虎鱼、髭缟虾虎鱼、孔虾虎鱼、蓝点深虾虎鱼、红狼牙虾虎鱼、普氏细刺虾虎鱼、斑尾刺虾虎鱼、大弹涂鱼、矛尾虾虎鱼、舟山缰虾虎鱼、台湾沟虾虎鱼、矛尾刺虾虎鱼、双带缟虾虎鱼、犬齿背眼虾虎鱼、平头竿虾虎鱼、龙头鱼、带鱼、鲻鱼、鳜鱼、青石斑鱼、宝石石斑鱼、褐牙鲆、横带髭鲷、斜带髭鲷、黄鳍刺鲷、条石鲷、二长刺鲷、角木叶鲽、斑鰶、三线舌鳎、刺鲳、银鲳、黑鲷、黄鲫、凤鲚。
3.一种如权利要求1所述的海洋鱼类线粒体12S rRNA基因扩增引物的设计方法,其特征是登录NCBI网站中的GenBank数据库搜索已测定的海洋鱼类线粒体基因组的tRNA-Phe和16S rRNA基因序列,经同源性比较,找到保守序列,并利用Premier Primer5.0软件设计出海洋鱼类线粒体12S rRNA基因扩增引物。
4.一种对海洋鱼类线粒体12S rRNA基因进行扩增的方法,其特征是采用如权利要求1所述的海洋鱼类线粒体12S rRNA基因扩增引物对待测样品的DNA模板溶液进行PCR扩增。
5.如权利要求4所述的一种对海洋鱼类线粒体12S rRNA基因进行扩增的方法,其特征是PCR扩增的条件为:95℃预变性5min,然后95℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸75s,共35个循环,最后72℃延伸5min。
6.如权利要求4所述的一种对海洋鱼类线粒体12S rRNA基因进行扩增的方法,其特征是PCR扩增的反应体系组成为:PCR反应体系为25μL,内含2.5mM的 dNTP 2μL、10×TaqDNA聚合酶 Buffer 2.5μL、10μM的轻链引物和重链引物各1μL、5U/ul的TaqDNA聚合酶0.2μL、含100ng的DNA模板溶液 1μL及ddH2O 17.3μL。
7.如权利要求4所述的一种对海洋鱼类线粒体12S rRNA基因进行扩增的方法,其特征是所述的待测样品来自包括小黄鱼、眼斑拟石首鱼、白姑鱼、黄姑鱼、日本黄姑鱼、黑鳃梅橦鱼、棘头梅橦鱼、褐鯧鮋、尖头黄鳍牙、中华乌塘鳢、青弹涂鱼、斑纹舌虾虎鱼、髭缟虾虎鱼、孔虾虎鱼、蓝点深虾虎鱼、红狼牙虾虎鱼、普氏细刺虾虎鱼、斑尾刺虾虎鱼、大弹涂鱼、矛尾虾虎鱼、舟山缰虾虎鱼、台湾沟虾虎鱼、矛尾刺虾虎鱼、双带缟虾虎鱼、犬齿背眼虾虎鱼、平头竿虾虎鱼、龙头鱼、带鱼、鲻鱼、鳜鱼、青石斑鱼、宝石石斑鱼、褐牙鲆、横带髭鲷、斜带髭鲷、黄鳍刺鲷、条石鲷、二长刺鲷、角木叶鲽、斑鰶、三线舌鳎、刺鲳、银鲳、黑鲷、黄鲫、凤鲚的海洋鱼类。
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