[发明专利]一种对虾MSAP技术分析体系的建立方法在审
申请号: | 201210248947.5 | 申请日: | 2012-07-18 |
公开(公告)号: | CN102747160A | 公开(公告)日: | 2012-10-24 |
发明(设计)人: | 何玉英;李健;王清印;杜盈 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 青岛联智专利商标事务所有限公司 37101 | 代理人: | 袁和善;刘晓 |
地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 对虾 msap 技术 分析 体系 建立 方法 | ||
1.一种对虾MSAP技术分析体系的建立方法,其特征在于包括如下步骤:(1)首先提取对虾基因组DNA,并稀释备用;(2)建立双酶切反应体系和连接反应体系;(3)建立预扩增反应体系和预扩反应程序;(4)建立选扩反应体系和反应程序;(5)聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染后获得所需条带。
2.根据权利要求1所述的对虾MSAP技术分析体系的建立方法,其特征在于:所述步骤(1)中提取的是中国对虾基因组DNA,稀释成200ng/μL,并在-20℃保存待用。
3.根据权利要求1所述的对虾MSAP技术分析体系的建立方法,其特征在于:所述步骤(2)中,双酶切反应体系的总体积为20μL,包括DNA模板200ng, HpaII或MspI 7.5U, EcoRI 7.5 U,10×buffer 2μL,加ddH2O至20μL,37℃ 8h;连接反应体系为25 μL,包括酶切产物5 μL,50pmol的HM接头和5pmol EcoRI接头,2.5U T4 DNA 连接酶,16℃,12h。
4.根据权利要求1所述的对虾MSAP技术分析体系的建立方法,其特征在于:所述步骤(3)中,预扩增反应体系为20μL,包括预扩引物各20pmol,Taq DNA酶 1U,dNTPs 4 pmol,10× Taq buffer 2.2 μL,稀释10倍的连接产物1μL,加ddH2O至20μL;预扩反应程序为:94℃ 30s,94℃ 30s,56℃ 30s,72℃ 2min,10个循环,60℃ 30min。
5.根据权利要求1所述的对虾MSAP技术分析体系的建立方法,其特征在于:所述步骤(4)中,选扩反应体系为20 μL,包括选扩引物各30pmol,Taq DNA酶 1U, dNTPs 4 pmol,10× Taq buffer (含Mg2+30pmol) 2.0μL,稀释10倍的预扩产物5 μL,加ddH2O至20μL;选扩反应程序为:94℃ 30s,94℃ 30s,65℃ 30s,72℃ 102min, 10个循环,72℃ 10min,94℃ 30s, 56℃ 30s,72℃ 2min,60℃ 30min,20个循环。
6.根据权利要求1所述的对虾MSAP技术分析体系的建立方法,其特征在于:所述步骤(5)中,选扩产物与甲酰胺变性上样液以2:1的比例混合,94℃ 5min,冰浴10min,采用65W恒功率进行6%聚丙烯酰胺凝胶电泳2h,银染。
7.根据权利要求6所述的对虾MSAP技术分析体系的建立方法,其特征在于:所述银染的方法:(1)固定:2L 1%的冰醋酸1h;(2)漂洗:1.5L ddH2O漂洗两次,每次2min;(3)染色:1.5L银染液,0.5-1h,银染液组成:1.5gAgNO3+2.25L37%甲醛+315mL10mg/mLNa2S2O3 +1.5LddH2O;(4)显影:1.5L显影液,3-5min,显影液组成:7.5gNaOH+2.25L 37%甲醛+1.5L ddH2O;(5)固定:1L ddH2O 5min。
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