[发明专利]金核霉素的生物合成基因簇及其应用有效
申请号: | 201210236348.1 | 申请日: | 2012-07-09 |
公开(公告)号: | CN103540603A | 公开(公告)日: | 2014-01-29 |
发明(设计)人: | 唐功利;李玮涛;潘海学;蹇晓红 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海有机化学研究所 |
主分类号: | C12N15/55 | 分类号: | C12N15/55;C12N15/53;C12N15/31;C12N9/14;C12N15/63;C12N1/20;C12N1/21;C12P17/18;C07K14/36;C12R1/49 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 崔佳佳;赵向辉 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 霉素 生物 合成 基因 及其 应用 | ||
1.一种金核霉素生物合成基因的集合,其特征在于,所述基因集合由编码AnmB蛋白的基因、编码AnmC蛋白的基因、编码AnmD蛋白的基因、和编码AnmE蛋白的基因构成。
2.如权利要求1所述的基因的集合,其特征在于,
所述的AnmB蛋白包括选自下组的多肽:
(a)氨基酸序列如SEQ ID NO:3所示的多肽;或
(b)包含(a)所限定的序列经过一个或多个(较佳地1-10个,更佳地1-5个)氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的序列,且基本具有(a)所限定的多肽功能的由(a)衍生的多肽;
所述的AnmC蛋白包括选自下组的多肽:
(a)氨基酸序列如SEQ ID NO:4所示的多肽;或
(b)包含(a)所限定的序列经过一个或多个(较佳地1-10个,更佳地1-5个)氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的序列,且基本具有(a)所限定的多肽功能的由(a)衍生的多肽;
所述的AnmD蛋白包括选自下组的多肽:
(a)氨基酸序列如SEQ ID NO:5所示的多肽;或
(b)包含(a)所限定的序列经过一个或多个(较佳地1-10个,更佳地1-5个)氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的序列,且基本具有(a)所限定的多肽功能的由(a)衍生的多肽;和
所述的AnmE蛋白包括选自下组的多肽:
(a)氨基酸序列如SEQ ID NO:6所示的多肽;或
(b)包含(a)所限定的序列经过一个或多个(较佳地1-10个,更佳地1-5个)氨基酸残基的取代、缺失或添加而形成的序列,且基本具有(a)所限定的多肽功能的由(a)衍生的多肽。
3.一种金核霉素生物合成基因簇,其特征在于,所述基因簇包括金核霉素生物合成涉及的4个基因,所述基因簇核苷酸序列如SEQ ID NO:1的第5294-10434位碱基所示,具体为:
1)基因anmB,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1的第5294-6964位碱基所示,编码的蛋白为腺苷高半胱氨酸水解酶,长度为556个氨基酸;
2)基因anmC,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1的第6957-8057位碱基所示,编码的蛋白为脱氢酶,长度为366个氨基酸;
3)基因anmD,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1的第8054-9172位碱基所示,编码的蛋白为氧化还原酶,长度为372个氨基酸;和
4)基因anmE,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1的第9169-10434位碱基所示,编码的蛋白为radical SAM相关蛋白,长度为421个氨基酸。
4.如权利要求3所述的金核霉素生物合成基因簇所编码的编码蛋白。
5.如权利要求4所述的编码蛋白,其特征在于,所述的编码蛋白为AnmB蛋白、AnmC蛋白、AnmD蛋白和AnmE蛋白,其氨基酸序列分别如SEQ ID NO:3-6所示。
6.如权利要求1或2所述的金核霉素生物合成基因的集合,或权利要求3所述的金核霉素生物合成基因簇,或权利要求4或5所述的编码蛋白的用途,其特征在于,用于合成抗生素金核霉素、金核霉素的药学上可接受的盐及类似物。
7.一种载体,其特征在于,所述载体含有权利要求1或2所述的金核霉素生物合成基因的集合,或含有权利要求3所述的金核霉素生物合成基因簇。
8.一种重组的宿主细胞,其特征在于,含有权利要求7所述的载体或染色体上整合有单拷贝或多拷贝的外源的权利要求1或2所述的金核霉素生物合成基因的集合,或单拷贝或多拷贝的权利要求3所述的金核霉素生物合成基因簇。
9.一种产生金核霉素的方法,其特征在于,包括步骤:培养权利要求8所述的宿主细胞,从而表达金核霉素;以及从培养体系中分离金核霉素。
10.一种金色链霉菌,其特征在于,所述金色链霉菌是金色链霉菌苏州变种(CGMCC No.0122)的突变株,所述突变株中金核霉素生物合成基因簇中的一个或多个基因失活,从而不产生金核霉素。
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