[发明专利]用于提取试管树苗的基因组DNA的试样制备方法有效
申请号: | 201210236236.6 | 申请日: | 2012-07-10 |
公开(公告)号: | CN103540584A | 公开(公告)日: | 2014-01-29 |
发明(设计)人: | 孙清荣;孙洪雁;辛力;周广芳 | 申请(专利权)人: | 山东省果树研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 泰安市泰昌专利事务所 37207 | 代理人: | 姚德昌 |
地址: | 271000 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 提取 试管 树苗 基因组 dna 试样 制备 方法 | ||
1.一种用于提取试管树苗的基因组DNA的试样制备方法;其特征是:其步骤是:(1)、把研磨至粉末状的试管树苗进行预前处理,预前处理步骤为:a、把增殖生长30-40天的试管树苗顶部嫩梢,研磨至粉末加入离心管中,按照试管树苗与提取液体积与β-巯基乙醇的比例1 g : 3-10 ml : 25-80 ul,依次加入提取液和β-巯基乙醇,摇动混合均匀;在温度为3-6℃的环境中,在离心力为8000-12000 g的离心机中把离心管运行8-12分钟;b、抛弃上清部分,沉淀再次加入提取液,上下颠倒离心管使沉淀充分溶解,在温度为3-6℃的环境中,在离心力为8000-12000 g的离心机中把离心管运行8-12分钟;C、至少重复步骤b两次,在离心管中得到的沉淀物即为经过预前处理的前期试样,(2)、使用高盐CTAB提取液按照CTAB方法,得到试管树苗进行提取基因组DNA的后期试样。
2.根据权利要求1所述的用于提取试管树苗的基因组DNA的试样制备方法;其特征是提取液设置为包含有100-120mM pH值为 8的Tris-HCl、 4-6mM pH值为 8的EDTA、0.35-0.5 M 山梨醇、0.2-2%w/vβ-巯基乙醇。
3.根据权利要求1所述的用于提取试管树苗的基因组DNA的试样制备方法;其特征是:高盐CTAB提取液设置为包含有40-60 mM pH值为 8的Tris-HCl、4-6 M pH值为 8的NaCl、25-30 mM pH值为 8的EDTA、 1.5-2.5 % w/v CTAB、1-2%w/vPVP、8-12%w/v十二烷酰基肌氨酸钠。
4.根据权利要求1所述的用于提取试管树苗的基因组DNA的试样制备方法;其特征是:其步骤为:
(1)、 称取0.1-0.3 g增殖生长30-40天的试管树苗顶部嫩梢,放入直径为5cm的小研钵中,加入液氮用研杵快速研磨至粉末,加入0.8-1.0 ml提取液,转移到1.5 ml 离心管中,置于冰上存放,再去研磨第二个样品;所有样品准备好后,在通风厨内向每一离心管内加入8-10 ul β-巯基乙醇,摇动混合均匀;
(2)、在温度为3-6℃的环境中,在离心力为8000-12000 g的离心机中运行8-12分钟;
(3)、丢弃上清部分,加入提取液,充分溶解沉淀,重复第2步骤;
(4)、重复第3步骤;
(5)、在每个离心管中,加入450-550 ul 提取液使沉淀充分溶解,然后再加入300-400 ul 高盐CTAB提取液,混匀后,置于温度为65℃水浴中孵育45-90分钟;期间摇动几次离心管,即每个离心管为试样Ⅰ;
(6)、 在每个含有试样Ⅰ的离心管中加入等体积氯仿,颠倒混合均匀,在温度为3-6℃的环境中,在离心力为8000-12000 g的离心机中运行8-12分钟;
(7)、吸取上清物到另一个离心管,再加入等体积氯仿,重复第6步骤;
(8)、吸取上清物到一新的离心管,加入2倍体积的100%的乙醇和1/10体积的3M NaAC, 颠倒混匀,在温度为-18--22℃的环境中,放置30分钟或过夜;
(9)、在温度为3-6℃的环境中,在离心力为8000-12000 g的离心机中运行8-12分钟;
(10)、丢弃上清部分,沉淀用70%-75%乙醇洗涤2-3次, 然后放到超净工作台上,无菌风吹干,每个离心管内的沉淀为试样Ⅱ;
(11)、在每个含有试样Ⅱ的离心管中加50-100 ul的电导率为3左右的纯净水溶解沉淀,再加入0.5-1.0 ul RNAase A, 置于温度为37℃水浴中孵育30-60分钟;
(12)、加入等体积氯仿,轻轻颠倒混合均匀,在温度为3-6℃的环境中,在离心力为8000-12000 g的离心机中运行8-12分钟;
(13)、 吸取上清物到另一个新离心管,再加入等体积氯仿,重复第12步骤;
(14)、吸取上清物到另一个离心管,加入2倍体积的100%乙醇和1/10体积的3M NaAC, 上下颠倒混合均匀,在温度为-18--22℃的环境中,放置至少2小时;
(15)、在温度为3-6℃的环境中,在离心力为8000-12000 g的离心机中运行8-12分钟;
(16)、丢弃上清部分,沉淀用70%-75%乙醇洗涤1-2次, 再放到超净工作台上,无菌风吹干,得到的沉淀即为试样Ⅲ;
(17)、把纯净水加入到试样Ⅲ中,放到温度为-18--22℃冰箱中保存备用。
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