[发明专利]特异性识别链霉素的DNA适配体及其应用有效
| 申请号: | 201210193641.4 | 申请日: | 2012-06-13 |
| 公开(公告)号: | CN102703453A | 公开(公告)日: | 2012-10-03 |
| 发明(设计)人: | 周楠迪;王靖元;田亚平 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
| 主分类号: | C12N15/115 | 分类号: | C12N15/115;C12N15/10;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 无锡市大为专利商标事务所 32104 | 代理人: | 时旭丹;刘品超 |
| 地址: | 214122 江苏省无锡市滨*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 特异性 识别 链霉素 dna 适配体 及其 应用 | ||
1.特异性识别链霉素的单链DNA(ssDNA)适配体,选自序列表A1~A16所示序列的一种或多种,包括含有A1~A16所述序列的ssDNA。
2.根据权利要求1所述的适配体,选自序列A1、A3、A6或A12所示的序列,包括含有A1、A3、A6、A12所述序列的ssDNA。
3.根据权利要求1或2所述的适配体,其特征在于被能提高稳定性的基团,提供检测信号的荧光基团、同位素、电化学标记物、酶标记物,以及用于形成组合物的亲和配基、巯基所修饰。
4.用于链霉素检测的组合物、试剂盒或芯片,其特征在于其中含有权利要求1-3中任一项的适配体。
5.用于链霉素检测的方法,其特征在于使可能含有链霉素的样品与权利要求1-3中任一项的适配体接触,并检测链霉素与所述适配体的结合。
6.筛选特异性结合链霉素的ssDNA适配体的方法,其特征在于包括步骤(a)-(j):
(a)筛选文库:ssDNA文库;
(b)亲和磁珠:环氧基修饰磁珠,粒径1-2μm,浓度为10mg/mL;
(c)偶联有链霉素的亲和磁珠(b);
(d)使步骤(a)中的筛选文库和步骤(c)中的偶联链霉素的亲和磁珠在适宜的条件下保温、洗涤;所述适宜条件是指使筛选文库中的成员能和偶联链霉素的亲和磁珠特异性结合的条件,包括温度、作用时间、结合缓冲液成分;
(e)收集经步骤(d)处理的与(c)中偶联链霉素亲和磁珠结合的文库成员;
(f)对步骤(e)的文库成员进行PCR扩增处理,下游引物5’-端标记生物素;
(g)将步骤(f)中的文库成员与链霉亲和素磁珠在适宜条件下接触,得到单链次级文库,将单链次级文库与步骤(c)中偶联链霉素的亲和磁珠在适宜条件下接触;
(h)收集步骤(e)或(g)中与(c)特异性结合的文库成员;
(i)重复步骤(d)~(h),重复次数1、2、3、4、5、6、7或8次;
(j)任选地,对(g)步骤获得的文库成员进行确定,进行序列测定。
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