[发明专利]一种蓝鳃太阳鱼遗传多样性分析方法

权利要求书

1.一种蓝鳃太阳鱼遗传多样性分析方法，它包括以下步骤：

（1）从尾静脉采血，提取基因组DNA；

（2）测定DNA完整性和浓度；

（3）利用随机引物进行PCR反应；

（4）扩增产物电泳分离；

（5）根据迁移率计算各群体遗传变异的各个参数。

2.根据权利要求1所述的一种蓝鳃太阳鱼遗传多样性分析方法，其特征在于：所述的步骤1中，采集的血样使用蛋白酶K消化12小时以上。

3.根据权利要求1所述的一种蓝鳃太阳鱼遗传多样性分析方法，其特征在于：所述的步骤1中，用酚氯法提取基因组DNA。

4.根据权利要求1所述的一种蓝鳃太阳鱼遗传多样性分析方法，其特征在于：所述的步骤2中，提取的DNA样本用琼脂糖凝胶电泳进行电泳，电泳完成后通过紫外分光光度计检验DNA完整性和浓度。

5.根据权利要求1所述的一种蓝鳃太阳鱼遗传多样性分析方法，其特征在于：所述的步骤4中，扩增产物在2±0.5％的琼脂糖进行电泳，分离不同分子量大小的DNA片段。

6.根据权利要求1所述的一种蓝鳃太阳鱼遗传多样性分析方法，其特征在于：所述的步骤5中，所述的根据迁移率计算各群体遗传变异的各个参数，其实现过程如下：

根据电泳结果，迁移率相同的都视为同一位点，有带的记为1，无带的记为0，将电泳图转化为0、1矩阵，根据RAPD扩增结果所统计的数据，计算各群体遗传变异的各个参数，

多态位点比例P的计算公式：                                                ，

群体内和群体间的遗传相似系数的计算公式：，

其中，N_xy是个体x、y的共有条带数；N_x和N_y分别是个体x和y的扩增条带数，平均遗传相似系数通过群体内和群体间各个体间的相似系数平均而求得。

7.群体内和群体间的遗传距离计算公式：D=1-S，

Nei基因多样性指数 (He)^[12]：，

其中，p_i为第i个位点在群体中出现的频率，n为所测位点总数。