[发明专利]燕麦噬酸菌西瓜亚种的蛋白质指纹图谱模型及其应用有效
申请号: | 201210157862.6 | 申请日: | 2012-05-21 |
公开(公告)号: | CN103424463A | 公开(公告)日: | 2013-12-04 |
发明(设计)人: | 冯建军;章桂明;李健强;郑耘;李一农;娄定风 | 申请(专利权)人: | 深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心 |
主分类号: | G01N27/64 | 分类号: | G01N27/64 |
代理公司: | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 | 代理人: | 罗瑶 |
地址: | 518045 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 燕麦 噬酸菌 西瓜 蛋白质 指纹 图谱 模型 及其 应用 | ||
1.一种燕麦噬酸菌西瓜亚种的蛋白质指纹图谱模型,其特征在于:根据燕麦噬酸菌西瓜亚种的多个蛋白质的质荷比及其蛋白质波峰强度系数绘制而成,所述多个蛋白质的质荷比包括3171.4、3735.0、4963.5、5139.0、5866.4、6554.1、7466.1、7948.0、8384.5、9304.2、9504.3、9920.0、10272.8、10840.7、12530.5、12896.5。
2.根据权利要求1所述的蛋白质指纹图谱模型,其特征在于:所述蛋白质的质荷比值及其波峰强度系数由基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪的软件统计分析得到。
3.一种包括权利要求1或2所述的蛋白质指纹图谱模型的蛋白质检测分析数据库。
4.权利要求1或2所述的蛋白质指纹图谱模型在燕麦噬酸菌西瓜亚种的检测或鉴定中的应用。
5.一种燕麦噬酸菌西瓜亚种的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱检测方法,包括样品蛋白质芯片制备、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪检测,以及样品蛋白质图谱比对。其特征在于:所述样品蛋白质图谱比对是将基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪检测分析获得的样品蛋白质图谱,与权利要求1或2所述的蛋白质指纹图谱模型比较;或者在权利要求3所述的蛋白质检测分析数据库中比对。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于:所述样品蛋白质芯片制备包括释放样品蛋白质的前处理和点样,所述点样的步骤包括,先在质谱靶芯片上滴加样品上清液,晾干后再滴加基质溶液。
7.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于:所述基质溶液的溶剂为乙腈:甲醇:无菌去离子水按体积比1:0.8-1.2:0.8-1.2混合而成。
8.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于:所述基质溶液的溶质为α-氰基-4-羟基肉桂酸。
9.根据权利要求6所述的检测方法,其特征在于:所述释放样品蛋白质的前处理采用的溶剂包括第一溶剂、第二溶剂和第三溶剂中的至少一种;
第一溶剂为0.1%的三氟乙酸,第二溶剂为70%的甲酸,第三溶剂为100%乙腈。
10.根据权利要求5-9任一项所述的检测方法,其特征在于:所述样品蛋白质图谱比对采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪自带的软件进行,且比对获得的log(score)值为大于2.2小于3.0。
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