[发明专利]一株可以在人肠道中定植并繁殖的益生菌及其检测方法无效
申请号: | 201210150968.3 | 申请日: | 2012-05-15 |
公开(公告)号: | CN102747012A | 公开(公告)日: | 2012-10-24 |
发明(设计)人: | 张佳超;王丽凤;高鹏飞 | 申请(专利权)人: | 北京和美科盛生物技术有限公司 |
主分类号: | C12N1/20 | 分类号: | C12N1/20;C12Q1/68;C12Q1/06;C12R1/25 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 李正清 |
地址: | 100102 北京市朝阳区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 可以 肠道 定植 繁殖 益生菌 及其 检测 方法 | ||
1.一株可以定植于肠道中的益生菌,其特征在于所述益生菌(Lactobacillusplantarum P8)分离自由中国境内采集的酸马奶样本,保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物菌种保藏中心,保藏号:CGMCC No.5468,保藏日期为:2011年11月18日。
2.可以定植于肠道益生菌在肠道中的检测方法,其特征是包括下列步骤:
(1)粪便样品中宏基因组DNA的提取
采用液氮冻融—CTAB法:取1.0g粪便样品洗涤处理,将洗脱的菌体于1.5mL离心管中,立即置于液氮中完全冻结,取出后放入65℃水浴中融化(约5min),反复冻融3次,加0.1mL 10%SDS和10.0μL 10mg/mL蛋白酶K,于37℃恒温摇床中200r/min摇动2h,室温下12000g离心10min,收集上清液转移至另一离心管中。上清液与等体积的氯仿于12000g离心10min(为了使沉淀、水相和有机相分层),吸取上清液转移至另一离心管中进行酚氯仿抽提2次,经0.1倍体积的醋酸钠,1倍体积的冰异丙醇沉淀总DNA,然后70%乙醇洗涤沉淀2次,回溶备用。
(2)L.plantarum P8的特异性片段的扩增
扩增引物:以L.plantarum P8的全基因组序列为依据,引物前序列及扩增片段的具体信息为:
ATCGGTTAGGGCGTGCGCCGAGCGGAAATTATCAATGGCTTACGATGGTCAGTAGTAGCGGACGCATTAGGGTTGCCCGCGGAAAATCGTCAACGGGGAACTTATCCGTTAATTACGGAAATGGTCGCAAGTGACTTTTGGAAACAGCCAGCAGGGAGCTGGTCTGATGACACATCGATGAGTTTAGGATTGATTGAGAATTTGGTTAGCGGTGGTGATTATGATGATCTCATATGCGCTTTGGAACGAACACGC
扩增体系:反应体系50μL:10×PCR Buffer 5μL,25mmo1/L Mg2+1.0μL,2.5mmol/L dNTPs 4μL,5mmol/L上下游引物各2μL,DNA模板100ng左右,5U/μL Taq酶(Promega)0.5uL,dd H2O补足至50μL;
扩增条件:95℃变性5min;循环30次:95℃变性1min,62℃退火45s,72℃延伸1min,然后72℃延伸7min,4℃保存。
(3)琼脂糖凝胶电泳:将PCR产物于1%琼脂糖凝胶中以5V/cm的电压,电泳20-30min,EB染色,紫外拍照,检测扩增效果;
(4)RT-PCR检测样品中L.plantarum P8的数量:
首先应用已知数量的L.casei Zhang通过RT-PCR扩增制作标准曲线,然后以标准曲线为依据,用上述特异性引物定量检测样品中L.casei Zhang的数量;
RT-PCR扩增体系:反应体系20μL:10×PCR mix 10μL,10mmol/L上下游引物各0.4μL,DNA模板100ng左右,dd H2O补足至20μL。
RT-PCR扩增条件:95℃变性20s;循环40次:95℃变性5s,62℃退火30s,72℃延伸45s。
(5)肠道中益生菌L.plantarum P8定植能力的检测
随机选取33名近三个月内无抗生素类药物摄入的志愿者(性别比例17∶16),每日服用含益生菌Lactobacillus plantarum P8的片剂(活菌数>2x1010个/粒)3粒,连续服用28天,分别于0天,14天,28天以及停止服用菌片后一周即第35天,两周即第42天和四周即第56天采集志愿者粪便样品;样品采集后迅速放入液氮中速冻,并在8小时内完成粪便样品宏基因组DNA的提取;而后应用Lactobacillus plantarum P8的特异性引物进行RT-PCR扩增,检测不同时间内各志愿者体内Lactobacillus plantarum P8的残留量,进而判断其定植能力。
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