[发明专利]山羊SH2B1基因单核苷酸多态性位点及其检测方法有效
申请号: | 201210122451.3 | 申请日: | 2012-04-17 |
公开(公告)号: | CN102703440B | 公开(公告)日: | 2017-10-24 |
发明(设计)人: | 陈宏;刘宣宣;房兴堂;张春雷 | 申请(专利权)人: | 江苏师范大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司61200 | 代理人: | 蔡和平 |
地址: | 221116 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 山羊 sh2b1 基因 核苷酸 多态性 及其 检测 方法 | ||
1.一种检测山羊SH2B1基因单核苷酸多态性位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)、以包含SH2B1基因的待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P2为引物,PCR扩增山羊SH2B1基因;
所述的引物对P2为:
上游引物:5’CCTCCGCTTCAAAGTGCTG 3’
下游引物:5’GCGGGAGTTCTGCGAGTC 3’
(2)、对步骤(1)的扩增产物进行PCR产物的切胶回收及纯化、测序;
(3)、对步骤(2)的纯化产物进行PCR-SSCP检测:首先对纯化的PCR产物分别用变性剂进行变性处理,然后根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果判定其多态性位点的基因型,所述多态性位点包括:
在山羊的SH2B1基因第6033位为G或A的碱基多态性位点,表现为GG,GA两种基因型,所述第6033位为G或A的碱基多态性位点是指扩增产物5’CTCGGCAA 3’序列段中第4位为G或A的碱基多态性位点,基因型GA的体长显著高于纯合基因型GG。
2.如权利要求1所述的检测山羊SH2B1基因单核苷酸多态性位点的方法,其特征在于,所述的PCR扩增反应程序为:95℃预变性4min;94℃变性45s,58℃退火50s,72℃延伸1min,32个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存。
3.如权利要求1所述的检测山羊SH2B1基因单核苷酸多态性位点的方法,其特征在于,所述的聚丙烯酰胺凝胶电泳采用10%的聚丙烯酰胺凝胶。
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