[发明专利]狼山鸡POU1F1基因单核苷酸多态性位点及其检测方法在审

专利信息
申请号: 201210114963.5 申请日: 2012-04-18
公开(公告)号: CN102649957A 公开(公告)日: 2012-08-29
发明(设计)人: 陈宏;刘垚;房兴堂;张春雷;严林俊 申请(专利权)人: 江苏师范大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 221116 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 山鸡 pou1f1 基因 核苷酸 多态性 及其 检测 方法
【权利要求书】:

1.狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点,其特征在于:所述基因单核苷酸多态性位点包括:

在狼山鸡POU1F1基因的第3109位为G或A的碱基多态性位点。

2.权利要求1所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)、以包含POU1F1基因的待测狼山鸡全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增狼山鸡POU1F1基因;

所述的引物对P为:

上游引物:5’TTTCTTTTGGTTTTGTTCAG3’

下游引物:5’TTTTCAGCCTTTTGTTGG3’;

(2)、对步骤(1)的PCR扩增产物进行切胶回收及纯化、测序;

(3)、对步骤(2)的纯化产物进行PCR-SSCP检测:用变性剂对PCR扩增产物进行变性处理,再进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定狼山鸡POU1F1基因的多态性位点。

3.如权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:所述的PCR扩增的反应程序为:95℃预变性4min;94℃变性50s,59℃退火50s,72℃延伸1min,33个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存。

4.根据权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:步骤(2)中用琼脂糖凝胶电泳对PCR扩增产物进行切胶回收及纯化、测序。

5.根据权利要求4所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:步骤(2)中琼脂糖凝胶电泳中所用琼脂糖凝胶的质量浓度为1.5%。

6.根据权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:步骤(3)中聚丙烯酰胺凝胶的质量浓度为10%。

7.如权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于:步骤(3)中根据10%的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定狼山鸡POU1F1基因的多态性位点,所述多态性位点包括:在狼山鸡POU1F1基因的第3109位为G或A的碱基多态性位点,表现为CC,CD,DD三种基因型。

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