[发明专利]狼山鸡POU1F1基因单核苷酸多态性位点及其检测方法在审
申请号: | 201210114963.5 | 申请日: | 2012-04-18 |
公开(公告)号: | CN102649957A | 公开(公告)日: | 2012-08-29 |
发明(设计)人: | 陈宏;刘垚;房兴堂;张春雷;严林俊 | 申请(专利权)人: | 江苏师范大学 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68 |
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地址: | 221116 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 山鸡 pou1f1 基因 核苷酸 多态性 及其 检测 方法 | ||
1.狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点,其特征在于:所述基因单核苷酸多态性位点包括:
在狼山鸡POU1F1基因的第3109位为G或A的碱基多态性位点。
2.权利要求1所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)、以包含POU1F1基因的待测狼山鸡全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增狼山鸡POU1F1基因;
所述的引物对P为:
上游引物:5’TTTCTTTTGGTTTTGTTCAG3’
下游引物:5’TTTTCAGCCTTTTGTTGG3’;
(2)、对步骤(1)的PCR扩增产物进行切胶回收及纯化、测序;
(3)、对步骤(2)的纯化产物进行PCR-SSCP检测:用变性剂对PCR扩增产物进行变性处理,再进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定狼山鸡POU1F1基因的多态性位点。
3.如权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:所述的PCR扩增的反应程序为:95℃预变性4min;94℃变性50s,59℃退火50s,72℃延伸1min,33个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存。
4.根据权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:步骤(2)中用琼脂糖凝胶电泳对PCR扩增产物进行切胶回收及纯化、测序。
5.根据权利要求4所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:步骤(2)中琼脂糖凝胶电泳中所用琼脂糖凝胶的质量浓度为1.5%。
6.根据权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性位点的检测方法,其特征在于:步骤(3)中聚丙烯酰胺凝胶的质量浓度为10%。
7.如权利要求2所述的狼山鸡POU1F1基因的单核苷酸多态性的检测方法,其特征在于:步骤(3)中根据10%的聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定狼山鸡POU1F1基因的多态性位点,所述多态性位点包括:在狼山鸡POU1F1基因的第3109位为G或A的碱基多态性位点,表现为CC,CD,DD三种基因型。
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