[发明专利]用于检测转基因玉米MIR162的特异性引物、探针及其应用无效
申请号: | 201210053592.4 | 申请日: | 2012-03-02 |
公开(公告)号: | CN102586442A | 公开(公告)日: | 2012-07-18 |
发明(设计)人: | 路兴波;张广远;孙红炜;李凡;杨淑珂 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 杨琪 |
地址: | 250100 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 转基因 玉米 mir162 特异性 引物 探针 及其 应用 | ||
1.一种用于检测转基因玉米MIR162的特异性引物,其特征在于:所述引物由上游引物和下游引物组成,其序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
2.权利要求1所述的用于检测转基因玉米MIR162的特异性引物在定性检测玉米及其相关产品是否含有MIR162转化事件中的应用。
3.权利要求1所述的用于检测转基因玉米MIR162的特异性引物在SYBR Green I实时荧光定量PCR检测玉米及其相关产品是否含有MIR162转化事件中的应用。
4.一种用于检测转基因玉米MIR162的荧光标记探针,其特征在于:所述探针的序列如SEQ ID NO.3所示,探针的5′端连接一个荧光报告集团FAM,3′端连接有一个荧光淬灭集团Eclipse。
5.权利要求1所述的用于检测转基因玉米MIR162的特异性引物及权利要求4所述的用于检测转基因玉米MIR162的荧光标记探针在TaqMan探针实时荧光定量PCR检测玉米及其相关产品是否含有MIR162转化事件中的应用。
6.一种定性检测玉米及其相关产品是否含有MIR162转化事件的方法,其特征在于:步骤为:
(1)提取待检测样品的基因组DNA,并以此为模板,利用MIR162-F和MIR162-R引物组合进行PCR扩增;
(2)PCR扩增产物以琼脂糖凝胶电泳分离,EB染色后鉴定是否存在扩增产物;若存在扩增产物,则待检测样品中含有MIR162转化事件;若不存在扩增产物,则待检测样品中不含有MIR162转化事件。
7.一种SYBR Green I实时荧光定量PCR检测玉米及其相关产品是否含有MIR162转化事件的方法,其特征在于:步骤为:
(1)建立MIR162转化体特异性引物的SYBR Green I实时荧光定量PCR标准曲线和zSSIIb基因的SYBR Green I实时荧光定量PCR标准曲线:
①提取转基因玉米MIR162标准品基因组DNA进行梯度稀释,然后向各稀释液中加入MIR162转化事件的特异性引物,以及zSSIIb基因的国家标准引物,进行扩增;
②扩增后,测定各稀释液中相关荧光标记物的Ct值,该Ct值与拷贝数的自然对数呈线性关系,据此绘制MIR162转化事件的定量PCR标准曲线和zSSIIb基因的定量PCR标准曲线;
(2)提取待检测样品基因组DNA,得基因组DNA提取液,然后向基因组DNA提取液中加入MIR162基因的特异性引物,以及zSSIIb基因的国家标准引物,进行扩增;扩增后,测定基因组DNA提取液中相关荧光标记物的Ct值,然后根据上述绘制的MIR162基因的定量PCR标准曲线和zSSIIb基因的定量PCR标准曲线,计算出相应的拷贝数,则转基因玉米MIR162基因的拷贝数与玉米内标准基因zSSIIb基因的拷贝数之比,即为待检测样品中转基因玉米MIR162的百分含量。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤(1)①和(2)中,扩增的参数如下:扩增反应体积为20uL,2×Premix Ex Taq(Rox)10uL,浓度为10umol/L的Forward primer 0.4uL,浓度为10umol/L的Reverse primer 0.4uL,ddH2O 8.2uL,DNA模板1uL;扩增反应条件:95℃10min预变性;95℃15s,50℃30s,72℃30s,在72℃收集荧光信号,共计40个循环。
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