[发明专利]一种从细菌中分离纯化大质粒的方法无效
| 申请号: | 201210006772.7 | 申请日: | 2012-01-11 |
| 公开(公告)号: | CN102533730A | 公开(公告)日: | 2012-07-04 |
| 发明(设计)人: | 张海方;黄新祥;倪斌;杜鸿;许化溪;徐顺高;生秀梅 | 申请(专利权)人: | 江苏大学 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 卢亚丽 |
| 地址: | 212013 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 细菌 分离 纯化 质粒 方法 | ||
1.一种从细菌中分离纯化大质粒的方法,其特征在于步骤为:
(1)培养细菌:挑取单个菌落接种于4ml LB液体培养基,37℃振荡过夜培养后离心,收集菌体;
(2)制作胶块:用PIV缓冲液(10mM Tris,1M NaCl, PH7.6)洗涤后,取1ml PIV缓冲液重悬细菌,与1ml 2%的低熔点琼脂糖凝胶混匀,温度保持在50℃,灌入胶块浇制槽中制作细菌胶块;
(3) 消化蛋白:将胶块放入新鲜溶菌液Lysis buffer中37℃轻摇过夜,ES缓冲液洗涤模块后用ESP缓冲液50℃过夜消化已去除蛋白质;所述Lysis buffer的成分为6mM Tris,0.1M EDTA ,1M NaCl,0.5%Brij-58,0.2%脱氧胆酸钠,0.5%SDS, RNaseA 20μg/ml,溶菌酶1mg/ml;所述ESP缓冲液是含蛋白酶K100μg/ml 的ES缓冲液;
(4)电泳分离:用TE缓冲液充分洗涤上述经ESP缓冲液消化过夜的胶块,最后胶块上脉冲场凝胶电泳仪进行电泳,电泳条件为:电压6V/cm,角度120°,起始转换时间范围:1-10s,最后转换时间范围为20-60s,电泳时间范围为6-24h,电泳液缓冲液为0.5×TBE,温度保持在14℃;电泳后经EB染色以观察大质粒和染色体的分离情况;
(5)切胶回收:
①用手术刀切取含目的大质粒DNA的琼脂糖凝胶块并称重,先加入3倍胶重的溶胶液QX1,再加入2倍胶重的双蒸水;
②振荡30秒使QIAEXⅡ颗粒重悬,如果胶块中的DNA总量不超过2μg,则向样品溶胶液中加入10μl的QIAEXⅡ颗粒,然后50℃保温10min,每两分钟振荡一次使颗粒重悬,让胶块充分熔化释放出DNA结合到QIAEXⅡ颗粒上;此时混合物的颜色应为黄色,如果是橙色或紫色的话,应加入pH 5.0 3M的乙酸钠溶液调节其颜色至黄色,同时再继续保温至少5min;
③13000rpm离心30秒,小心地吸取上清,弃之;
④加入QX1缓冲液500μl,振荡重悬颗粒,洗涤颗粒,13000rpm离心30秒,小心地吸取上清,弃之,此步以洗去残留的凝胶;
⑤加入500μl缓冲液TE,振荡重悬颗粒,洗涤颗粒,13000rpm离心30秒,小心地吸取上清,弃之,此步以洗去残留的盐分;
⑥室温干燥10-15分钟,直到颗粒变白,加入pH 8.5 10mM Tris-HCl 缓冲液20μl以溶解大质粒DNA,取2μl 进行普通琼脂糖凝胶电泳以鉴定所提取的质粒DNA的纯度,其余于-20℃保存备用。
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