[发明专利]使用多基因计分预测向晚期老年性黄斑变性的进展

说明书

本发明涉及用于鉴定具有更大风险进展为晚期老年性黄斑变性(AMD)的患有中期AMD的个体的方法，所述方法使用基于全基因组基因关联研究的结果计算的多基因计分，并且使用数千种单核苷酸多态性(SNP)。

发明领域

本发明涉及用于鉴定具有更大风险进展为晚期老年性黄斑变性(AMD)的患有中期AMD的个体的方法，所述方法使用基于全基因组基因关联研究的结果计算的多基因计分，并使用数千种单核苷酸多态性(SNP)。

发明背景

老年性黄斑变性(Age-Related Macular Degeneration，AMD)

AMD是老年性黄斑变性，其是60岁以上个体不可逆视觉功能障碍的主要原因。存在两类AMD，非渗出性(干性)和渗出性(湿性)AMD。干性或非渗出性形式涉及在中心视网膜(黄斑)之下的视网膜色素上皮(RPE)的萎缩性及肥大性改变以及RPE上的沉淀(玻璃疣)。患有非渗出性AMD的患者可能进展为湿性或渗出性形式的AMD。当疾病进展时，初始形成的玻璃疣在尺寸和数量上增长。在AMD的晚期，被称为脉络膜新生血管膜(CNVM)的异常血管在视网膜下发展，渗出流体和血，并最终导致视网膜中和视网膜下的致盲的椭圆形瘢痕。非渗出性AMD，通常是渗出性AMD的前身，其更常见。

全基因组关联研究

在人基因组测序的同时，进行了国际范围的努力以开发人基因组的单体型图谱，即HapMap，其描述了人DNA序列变化的一般模式。HapMap项目始于2002年，并且通过定期的发表其结果已是公众可自由获知的。此外，基因分型(genotyping)技术和分析的快速改进已经使以下成为可能：在大群体上进行全基因组关联研究，从而鉴别具有显著群体频率的遗传变异。这又允许研究多基因病和性状。从那时起，全基因组关联研究已经识别大量遗传性基因座，其中存在与多基因性状可重复地关联的常见遗传变体。见，例如Altshuler等，Science(2008)，322：881-8(genetic mapping inhuman disease(人疾病中的基因定位))；Mohkle等，Hum Mol Genet(2008)17：R102-R108(common genetic variations associatedwith metabolic and cardiovasular diseases(与代谢和心血管疾病相关的常见遗传变异))；Lettre 等，Hum Mol Genet(2008)：17-R116-R121(common genetic variationsassociated with autoimmune diseases(与自体免疫疾病相关的常见遗传变异))；Purcell等，Nature(2009)460(7256)：748-52(common genetic variations associatedwith risk of schizophrenia and bipolar disorder(与精神分裂症和双相性精神障碍的风险相关的常见遗传变异))；和Wei等，PLoS Genet.(2009)5(10)：e1000678.Epub2009Oct9(I型糖尿病)。