[发明专利]产物离子光谱的数据独立获取及参考光谱库匹配

说明书

相关申请案的交叉参考

本申请案主张2010年9月15日申请的第61/383,137号美国临时专利申请案及2010年9月15日申请的第10009595.9号欧洲专利申请案的权益，其全文以引用的方式并入本文中。

技术领域

背景技术

多年来，已使用质谱分析对复杂混合物中的化合物进行识别及定量。一般的化合物可包括(但不限于)蛋白质、肽、药品化合物及衍生物(例如代谢物、麻醉剂、杀虫剂等)。常用的质谱分析技术为串联质谱分析。在串联质谱分析中，通过质量分析器来选择前驱物离子，所述前驱物离子以某种方式经片段化且所述片段在第二质量分析器内或在第一分析器的第二扫描内进行分析。所产生的片段可用于识别或定量。

常用的定量技术为选择反应监视(SRM)。SRM已长期用于对小型分子进行定量，且最近已应用于肽、蛋白质及其它生物化合物(例如脂质及碳水化合物)。一般在三级四极仪器上执行SRM，其中第一及第二质量分析器具有约0.7的质量离析峰值宽度，且在液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)分析期间，对前驱物与片段质量的一个或一个以上结合物(已知为过渡物)进行监视。

尽管SRM具有灵敏性及稳健性，但其至少具有限制其应用的以下若干问题：

1.在数据获取之前必须界定待测量的化合物，且必须从感兴趣的化合物的经验片段光谱或从此光谱的库来确定待监视的过渡物。

2.由于可在一单个分析期间进行测量的过渡物且因此化合物的数目由于若干原因受到限制，所以所获得的信息是不完整的。必须很好地界定色谱峰值，原因在于定量是基于过渡物的色谱中的峰值的高度或面积(即过渡物对时间的响应的曲线)进行的。因此，有必要尽可能的降低测量一组过渡物所花费的时间。灵敏性(可检测到的材料的最少量)取决于监视过渡物所花费的时间长度(驻留时间)，因此较好的灵敏性花费更多的时间，这意味着可分析较少的化合物。人们认为，已识别的正确化合物通常要求测量若干过渡物并将响应与从标准光谱所期望的那些响应进行对比。如果质量过渡窗口相对较宽以使在复杂化合物中可同时选择一个或一个以上前驱物或片段且干扰目标片段离子的测量，则以上看法就特别真实。精确且准确的定量要求包含可靠的标准材料(一般为目标化合物的同位素标记形式)，其产生可与目标化合物区分开的不同过渡物；也必须对这些进行监视，从而减少可进行分析的化合物的总数目。

3.此外，可用数据受到在执行分析之前所界定的数据的限制。因此，如果必须监视不同的或额外的过渡物以提高定量的置信度的准确性，或如果需要额外数据来检测不同化合物或者目标化合物的经改质形式，那么就经常有必要对样本进行再分析以产生额外的数据。

4.由于一次仅可分析有限数量的化合物，所以获得呈现在样本中的所有化合物的数据就需要许多单独分析。

一个替代获取方法使用高的及低的片段化交替进行扫描，接着对所述片段化进行处理以确定合为一体的前驱物(低能量)及片段(高能量)。由于在复杂混合物中，可同时对许多离子进行片段化，所以基于从此数据所提取的离子迹线的定量(类似于SRM)易于受到干扰。

其它替代获取方法选择跨越感兴趣的质量范围的小型质量窗口，但完全覆盖整个质量范围就需要大量的分析且花费相当多的时间。

因此，在同一分析中，在可进行分析的化合物的数目、且因此样本生产量(如果需要完全覆盖)、灵敏性与检测到使定量行为降级的干扰的可能性之间存在折衷。

发明内容

附图说明

所属领域的技术人员将了解，以下所描述的附图仅出于说明的目的。所述附图无意以任何方式限制本发明教示的范围。

图1为阐述可在其上实施本发明教示的实施例的计算机系统的框图。

图2为根据各种实施例展示如何使用质量分析器的步进式前驱物离子选择窗口获取整个质量范围的数据的示意图。

图3为根据各种实施例展示针对从参考光谱库所确定的片段从图2的离子迹线所抽取的质量迹线的示范性图表。

图4为根据各种实施例展示用于存储样本的所有可检测化合物的全部产物离子光谱的电子记录的系统的示意图。

图5为根据各种实施例展示用于存储样本的所有可检测化合物的全部产物离子光谱的电子记录的方法的示范性流程图。

图6为根据各种实施例包括一个或一个以上截然不同的软件模块的系统的示意图，所述软件模块执行用于存储样本的所有可检测化合物的全部产物离子光谱的电子记录的方法。