[发明专利]产物离子光谱的数据独立获取及参考光谱库匹配

权利要求书

1.一种用于存储样本的所有可检测化合物的全部产物离子光谱的电子记录的系统，其包括：

串联质谱仪，所述串联质谱仪：

在单一样本分析中使用多个质量选择窗口在整个质量范围内执行一次或一次以上多个产物离子扫描，从而产生每一质量选择窗口的所有可检测化合物的全部样本产物离子光谱；及

处理器，其与所述串联质谱仪通信，所述处理器：

从所述串联质谱仪接收每一质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱，且将每一质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱存储为所述样本的所有可检测化合物的电子记录，其中所述电子记录用于对在存储所述电子记录时已知的化合物进行表征或对在存储所述电子记录之后变为已知的化合物进行表征。

2.根据权利要求1所述的系统，其中所述多个质量选择窗口中的每一质量选择窗口具有大于15amu的宽度。

3.根据权利要求1所述的系统，其中所述处理器进一步接收与已知化合物相对应的预定产物离子光谱、从所述电子记录接收一个或一个以上质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱并且将所述预定产物离子光谱的预定产物离子与一个或一个以上质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱的样本产物离子进行比较，其中来自所述比较的一种或一种以上匹配的样本产物离子对在所述样本中可检测到的所述已知化合物进行表征。

4.根据权利要求3所述的系统，其中所述已知化合物包括肽、蛋白质、完整蛋白质组、内源性代谢物、脂质、碳水化合物或其组合中的一者或一者以上。

5.根据权利要求3所述的系统，其中所述已知化合物包括具有药品的、环境的、法医学的或工业重要性的一种或一种以上化合物。

6.根据权利要求3所述的系统，其中所述预定产物离子光谱是从所述已知化合物的可信标准、从对包含所述化合物的样本的分析、从现存光谱库确定，或者通过将经验的或先验的片段化或改质规则应用到所述已知化合物而以计算的方式产生。

7.根据权利要求3所述的系统，其中所述处理器通过以下方式将所述预定产物离子光谱的预定产物离子与一个或一个以上质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱的样本产物离子进行比较：

计算得分，所述得分表示所述预定产物离子与所述样本产物离子的匹配程度。

8.根据权利要求7所述的系统，其进一步包括分离装置，所述分离装置随着时间的推进而将所述单个样本分析的样本化合物分离，且其中当正分离所述样本化合物时，所述串联质谱仪在所述单个样本分析上执行多个产物离子扫描。

9.根据权利要求8所述的系统，其中所述得分是基于所述预定产物离子的迹线中的峰值与所述样本产物离子的迹线中的峰值的匹配程度而进一步计算。

10.根据权利要求9所述的系统，其中所述处理器进一步使用来自所述比较的所述一种或一种以上匹配的样本产物离子来计算所述样本的化合物的定量值。

11.根据权利要求3所述的系统，其中所述处理器进一步使用来自所述比较的所述一种或一种以上匹配的样本产物离子来识别所述已知化合物中的一种或一种以上化合物的经改质形式。

12.根据权利要求11所述的系统，其中所述处理器将所述匹配的样本离子与从所述预定离子及所述改质所预测的质量进行比较，以对所述改质的类型及位置进行表征。

13.根据权利要求11所述的系统，其中所述处理器进一步从所述电子记录提取所述被识别的经改质形式的光谱，以便对所述被识别的经改质形式中的所述改质的类型及位置进行表征。

14.一种用于存储样本的所有可检测化合物的全部产物离子光谱的电子记录的方法，其包括：

使用串联质谱仪在单一样本分析中使用多个质量选择窗口在整个质量范围内执行一次或一次以上多个产物离子扫描，从而产生每一质量选择窗口的所有可检测化合物的全部样本产物离子光谱；

使用处理器从所述串联质谱仪接收每一质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱；及

使用所述处理器将每一质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱存储为所述样本的所有可检测化合物的电子记录，其中所述电子记录用于对在存储所述电子记录时已知的化合物进行表征或对在存储所述电子记录之后变为已知的化合物进行表征。

15.一种计算机程序产品，其包括有形的计算机可读存储媒体，所述有形的计算机可读存储媒体的内容包含具有指令的程序，所述指令在处理器上执行以便执行用于存储样本的所有可检测化合物的全部产物离子光谱的电子记录的方法，所述方法包括：

提供系统，其中所述系统包括一个或一个以上截然不同的软件模块，且其中所述截然不同的软件模块包括测量模块及存储模块；及

使用所述测量模块从串联质谱仪接收每一质量选择窗口的所有可检测化合物的全部样本产物离子光谱，所述串联质谱仪在单一样本分析中使用多个质量选择窗口在整个质量范围内执行一次或一次以上多个产物离子扫描；及

使用所述存储模块将每一质量选择窗口的所述全部样本产物离子光谱存储为所述样本的所有可检测化合物的电子记录，其中所述电子记录用于对在存储所述电子记录时已知的化合物进行表征或对在存储所述电子记录之后变为已知的化合物进行表征。