[发明专利]胃癌标志物与胃癌检测方法

权利要求书

1.诊断或确定来自患者的生物样品中胃癌的预后的方法，所述方法包括以下步骤：

检测所述样品中与由SEQ.ID.NO.24组成的区域至少95％相似的连续序列中的至少15个连续碱基对的靶DNA序列的甲基化；

其中显著的甲基化水平指示胃癌的不良预后。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述靶序列的长度为至少50个碱基对并含有多个CpG碱基对。

3.如权利要求1或2所述的方法，还包括将患者样品中靶序列的甲基化水平与非癌细胞的甲基化水平进行比较。

4.如权利要求1-3中任一项所述的方法，其中所述确定或检测包括用能差异性地修饰甲基化的DNA和非甲基化的DNA的试剂处理样品。

5.如权利要求1-4中任一项所述的方法，其中所述区域由SEQ.ID.NO.11组成。

6.如权利要求1-5中任一项所述的方法，其中所述确定或检测包括用硫酸氢钠处理样品。

7.如权利要求1-6中任一项所述的方法，其中通过COBRA、BGS或MSP进行所述确定或检测。

8.如权利要求1-7中任一项所述的方法，其中所述样品是血液样品或粪便样品。

9.如权利要求1-8中任一项所述的方法，其中所述确定包括以下步骤：

a)使用根据SEQ.ID.NO.24中的含CpG的基因组序列所选择的引物来扩增用限制性酶处理的DNA；和

b)将未知样品中基因组序列的扩增部分的甲基化水平与非癌样品的甲基化水平进行比较，

从而检测胃癌的存在。

10.如权利要求1-9中任一项所述的方法，其中所述试剂包括优先切割非甲基化的DNA的酶。

11.如权利要求9所述的方法，其中所述扩增利用聚合酶链反应。

12.如权利要求1-11中任一项所述的方法，

其中所述检测使用选自以下的引物或探针：SEQ.ID.NOS.1、2、5、6、7、8、9、10、15、16、17、18、19、20和22。

13.分离的核酸序列，其与SEQ.ID.NO.24的10个连续碱基对的区域至少约95％相似。

14.如权利要求13所述的分离的核酸，其中所述分离的序列与SEQ.ID.NO.11的约20个连续碱基对的区域至少99％相似。

15.检测患者样品中的胃癌的方法，该方法包括检测所述样品中与SEQ.ID.NO.13在至少约15个连续碱基上至少95％相似的RNA序列的表达，其中与正常对照样品相比，所述序列的显著水平的降低表达指示胃癌的存在。

16.抑制胃癌细胞发展的方法，所述方法包括以下步骤：

在所述癌细胞中表达SEQ.ID.NO.23的生物学有效部分，从而抑制所述细胞的生长。

17.如权利要求16所述的方法，其中所述表达包括将所述胃癌细胞中与SEQ.ID.NO.24在至少15个连续碱基对上具有至少95％序列相似性的DNA序列脱甲基。

18.如权利要求16或17所述的方法，其中所述表达包括将分离的DNA分子引入所述细胞，所述分离的DNA分子适于表达与SEQ.ID.NO.23在约50个连续氨基酸上至少约95％相似的蛋白。

19.用于诊断或确定生物样品中的胃癌的预后的试剂盒，所述试剂盒包括用于检测所述样品中与由SEQ.ID.NO.24组成的区域至少95％相似的连续序列中的至少15个连续碱基对的靶DNA序列的甲基化的试剂，优选地，所述样品选自血液样品和粪便样品。

20.如权利要求19所述的试剂盒，其中所述靶序列的长度为至少50个碱基对并含有多个CpG碱基对。

21.如权利要求19或20所述的试剂盒，还包括非癌细胞的甲基化水平的对照。

22.如权利要求19-21中任一项所述的试剂盒，其中所述试剂可以差异性地修饰甲基化的DNA和非甲基化的DNA。

23.如权利要求19-22中任一项所述的试剂盒，其中所述区域由SEQ.ID.NO.11组成。