[发明专利]结核分枝杆菌海藻糖‑6‑磷酸磷酸酶OtsB2的表达纯化及与磷酸复合体的晶体三维结构有效
申请号: | 201110429168.0 | 申请日: | 2011-12-20 |
公开(公告)号: | CN103173426B | 公开(公告)日: | 2018-01-19 |
发明(设计)人: | 饶子和;单珊;杨诚;刘祥;娄智勇;孙玉娜;刘婷;姚利娜 | 申请(专利权)人: | 天津市国际生物医药联合研究院 |
主分类号: | C12N9/16 | 分类号: | C12N9/16;C12N15/63;C12N15/70;G06F19/16;C12R1/32 |
代理公司: | 北京德恒律师事务所11306 | 代理人: | 陆鑫,房岭梅 |
地址: | 300457 天津市滨*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 结核 分枝杆菌 海藻 磷酸 磷酸酶 otsb2 表达 纯化 复合体 晶体 三维 结构 | ||
1.一种结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的晶体或所述结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2与磷酸根复合体的晶体,其中所述海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的氨基酸序列为SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的第29和133位突变为甲硫氨酸后的氨基酸序列,且所述结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的晶体具有P2(1)2(1)2(1)的空间群,晶胞参数为:a=42埃,b=89埃,c=105埃,α=β=γ=90°,所述结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2与磷酸根复合体为所述结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2与一个游离磷酸根结合的复合体,所述结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2与所述磷酸根的相互作用如图2中的C。
2.表达和纯化结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的方法,包括:
(a)构建融合了标签蛋白基因的编码结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2基因序列的载体,将重组载体转化入原核或真核细胞,进而表达带有标签蛋白的海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2,其中,所述标签蛋白选自His、GST、Flag-tag、Mys-tag、MBP-tag、特异性抗体,所述载体含有卡那霉素选择性标记基因;
(b)将(a)获得的OtsB2蛋白通过特异性的与所述特异标签识别的方法分离出所述目的蛋白,经过Thrombin蛋白酶在4-30摄氏度透析酶切过夜,其中透析缓冲液使用pH8.0的20Mm Tris,100mM NaCl,1mM DTT(二硫苏糖醇),进一步将蛋白经过一系列亲和层析柱的方法进行纯化,通过丙烯酰胺凝胶的方法检测蛋白质纯度,得到纯化好的OtsB2蛋白,所述亲和层析柱用Resource Q离子交换层析、反挂Ni-NTA亲和层析柱、凝胶排阻层析,其中反挂Ni-NTA亲和层析柱时,补充加入NaCl至终浓度300-500mM,并且通过浓缩的方法除去DTT(二硫苏糖醇),其中,所述结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的第29和133位突变为甲硫氨酸后的氨基酸序列。
3.根据权利要求2所述的表达纯化结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的方法,其中步骤(b)中所述透析酶切温度使用4-10摄氏度。
4.根据权利要求2所述的表达纯化结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的方法,其中所述原核细胞是大肠杆菌。
5.结晶结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的方法,包括:
(a)将表达纯化好的结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2蛋白浓缩至浓度为10-20mg/mL,并且补加DTT至终浓度10mM;
(b)在20%PEG3350,200mM甲酸铵的条件下用气相悬滴法生长晶体;
(c)通过seeding方法对所述晶体进行优化;
(d)获得结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2的晶体,其中,所述结核分枝杆菌海藻糖-6-磷酸磷酸酶OtsB2蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的第29和133位突变为甲硫氨酸后的氨基酸序列,且所述的晶体具有P2(1)2(1)2(1)的空间群,晶胞参数为:a=42埃,b=89埃,c=105埃,α=β=γ=90°。
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