[发明专利]克里米亚-刚果出血热病毒CCHFV重组核蛋白NP的表达纯化及晶体结构无效
| 申请号: | 201110428458.3 | 申请日: | 2011-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN103172708A | 公开(公告)日: | 2013-06-26 |
| 发明(设计)人: | 饶子和;杨诚;王文明;纪伟;刘祥;姚利娜 | 申请(专利权)人: | 天津市国际生物医药联合研究院 |
| 主分类号: | C07K14/08 | 分类号: | C07K14/08;C12N15/40;C12N15/70 |
| 代理公司: | 北京德恒律师事务所 11306 | 代理人: | 陆鑫;房岭梅 |
| 地址: | 300457 天津市滨*** | 国省代码: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 克里米亚 刚果 出血热 病毒 cchfv 重组 核蛋白 np 表达 纯化 晶体结构 | ||
1.一种克里米亚-刚果出血热(CCHFV)病毒核蛋白NP的晶体结构,其中,所述的核蛋白NP为所述核蛋白NP的全长从第1位氨基酸到第482位氨基酸组成。其中所述晶体三维结构中的原子具有表1中所列的至少一部分的原子坐标、或者任何与该坐标中至少40%氨基酸残基的主链碳骨架原子三维坐标的平均根方差小于等于1.7埃的结构。
2.根据权利要求1所述的CCHFV NP的晶体结构,其中所述的母体晶体具有优选的,其中所述的CCHFV NP的晶体具有P2(1)2(1)2(1)的空间群,晶胞参数约为:a=58埃,b=68埃,c=131埃,α=β=γ=90°。
3.根据权利要求1所述的CCHFV NP由23个α螺旋所组成,即其中α螺旋1,即含Lys10-Asn24氨基酸区段,α螺旋2,即含Asp44-Ala51氨基酸区段,α螺旋3,即含Asp60-Lys72氨基酸区段,α螺旋4,即含Ile77-Ser84氨基酸区段,α螺旋5,即含Thr86-Lys98氨基酸区段,α螺旋6,即含Ala100-Lys104氨基酸区段,α螺旋7,即含Asp107-Val115氨基酸区段,α螺旋8,即含Ile120-Ile137氨基酸区段,α螺旋9,即含Ile162-Asn178氨基酸区段,α螺旋10,即含Try200-Lys206氨基酸区段,α螺旋11,即含Ile210-Phe213氨基酸区段,α螺旋12,即含Ala229-Glu240氨基酸区段,α螺旋13,即含Val246-Lys263氨基酸区段,α螺旋14,即含Lys270-Ala302氨基酸区段,α螺旋15,即含Thr306-Ala317氨基酸区段,α螺旋16,即含Pro321-Lys336氨基酸区段,α螺旋17,即含Thr341-Ser350氨基酸区段,α螺旋18,即含Lys354-Leu362氨基酸区段,α螺旋19,即含Ala382-Gly393氨基酸区段,α螺旋20,即含Pro400-Gln405氨基酸区段,α螺旋21,即含Thr410-Asn415氨基酸区段,α螺旋22,即含Cys426-Gly440氨基酸区段,α螺旋23,即含Ala450-Val460氨基酸区段。其中,CCHFV NP整体上呈现出一个类似于网球拍式的立体结构。由α螺旋1到α螺旋9以及α螺旋15到α螺旋23组成网球拍的头部,有α螺旋10到α螺旋14组成网球拍的把柄部分。其中,从Leu180-Ser194的氨基酸区段由于蛋白本身在此区域有着较强的柔性(flexibility),因此无法在三维晶体结构中获得。
4.根据权利要求1-3所述的CCHFV NP的晶体结构,其中所述的NP具有DNA特异性的核酸内切酶活性,活性中心主要由α螺旋3、α螺旋14、α螺旋15、α螺旋19、α螺旋21、α螺旋22和α螺旋23上的部分氨基酸残基构成。其中α螺旋15上的氨基酸残基Arg289、α螺旋19上的氨基酸残基Arg384、α螺旋23上的氨基酸残基His453和Gln457、α螺旋21上的氨基酸残基Lys411、α螺旋19上的氨基酸残基Glu387以及loop区的氨基酸残基Tyr374。
5.根据权利要求1-3所述的CCHFV NP的晶体结构,其中所述的NP晶体中存在大面积正电氨基酸聚集区域,功能为与RNA结合,形成RNA-NP复合物。RNA与NP结合的关键位点主要有Arg195、His197、Lys222、Arg225、Arg282、Lys286共6个氨基酸构成。
6.一种纯化CCHFV NP的方法,将权利1要求所述的CCHFV NP基因连接于带有标签的表达性质粒载体中,转化进入大肠杆菌细胞中进行表达、纯化。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述的标签选自GST、Flag-tag、Myc-tag、MBP-tag、His-tag、特异性抗体,所述载体含有选择性标记基因。
8.一种结晶前述权利要求中任何一项所述的CCHFV NP蛋白的方法,所述的方法包括:将CCHFV NP蛋白浓缩至5-10mg/ml,在4-30摄氏度下用气相扩散法筛选晶体生长条件。
9.一种衍射性能良好的根据前述权利要求中任一项所述的CCHFV NP蛋白质晶体。
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