[发明专利]基于SAA1β/β纯合子基因型的肝硬化预后诊断和/或肝硬化诊断的检测方法有效
申请号: | 201110418922.0 | 申请日: | 2011-12-15 |
公开(公告)号: | CN103160576A | 公开(公告)日: | 2013-06-19 |
发明(设计)人: | 王荣芳;吴峻;张艳;钱震斌 | 申请(专利权)人: | 德赛诊断系统(上海)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 201318 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 saa1 纯合子 基因型 肝硬化 预后 诊断 检测 方法 | ||
1.一种基于SAA1β/β纯合子基因型的肝硬化预后诊断和/或肝硬化诊断的检测方法,其特征在于,依据SAA1α、β、γ三个等位基因的核苷酸序列合成引物,对待测样品进行实时荧光定量等位基因特异性PCR,依据CT值及溶解曲线判断PCR扩增产物的基因型,经检测PCR产物的基因型为β/β基因型的,则待测样品属于肝硬化的易感人群。
2.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述引物包括:
A3套引物
所述上游引物5’-3’序列(Seq ID No.1)为:TCCCTTCTGCCTTTCCTTTCCTTTCC;
所述下游引物5’-3’序列(Seq ID No.2)为:TTACGTGATCGCTTCTGCAGCCCAGG;
A2套引物
所述上游引物5’-3’序列(Seq ID No.1)为:TCCCTTCTGCCTTTCCTTTCCTTTCC;
所述下游引物5’-3’序列(Seq ID No.3)为:TTACGTGATCGCTTCTGCAGCCCAGA;
B3套引物
所述上游引物5’-3’序列(Seq ID No.1)为:TCCCTTCTGCCTTTCCTTTCCTTTCC;
所述下游引物5’-3’序列(Seq ID No.4)为:TCCCAGGAGCTCCAGTTACGTGATCG;
B2套引物
所述上游引物5’-3’序列(Seq ID No.1)为:TCCCTTCTGCCTTTCCTTTCCTTTCC;
所述下游引物5’-3’序列(Seq ID No.5)为:TCCCAGGAGCTCCAGTTACGTGATCA。
3.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述引物还包括含引物序列(Seq ID No.1~SeqID No.5)的延伸引物系列。
4.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述引物3’端末端进行硫代磷酸化修饰。
5.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述实时荧光定量等位基因特异性PCR中,退火温度为60-67℃之间,PCR扩增片段长度为120-200bp;待测基因组DNA浓度范围为5-15ng之间。
6.如权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述肝硬化由肝脏疾病发展而成。
7.一种基于SAA1β/β纯合子基因型的肝硬化预后诊断和/或肝硬化诊断的试剂,其特征在于,其用于实施如权利要求1所述的检测方法,包括如权利要求2所述的引物;含人SAA1α、β、γ等位基因基因组DNA片段的质粒为阳性对照;pfu DNA聚合酶;荧光染料SYBR GreenI,及荧光校正染料ROX。
8.一种试剂盒,其特征在于,其用于实施如权利要求1所述的检测方法,包括如权利要求6所述的试剂。
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