[发明专利]过表达单一MicroRNA成熟体序列的新方法有效
申请号: | 201110359200.2 | 申请日: | 2011-11-14 |
公开(公告)号: | CN103103189A | 公开(公告)日: | 2013-05-15 |
发明(设计)人: | 沈南;曲波 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/85;C12N5/10 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陈静 |
地址: | 200031 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 表达 单一 microrna 成熟 序列 新方法 | ||
技术领域
本发明属于生物技术领域;更具体地,本发明涉及过表达单一MicroRNA成熟体序列的新方法。
背景技术
microRNA是一类长约22个碱基的、广泛存在于动植物体内的内源非编码RNA[1]。近10年来,随着对microRNA研究的不断深入,科学家们已经发现microRNA虽然不编码蛋白,但是,它们可以通过碱基互补配对的方式来识别与之相对应的靶mRNA,通过抑制翻译或是促使靶mRNA降解的方式影响基因表达[2]。microRNA能够参与诸如生长发育、免疫防御等许多生理过程,并且microRNA的调节异常可以参与到多个疾病的病理过程[3,4]。所以,microRNA作为一种新发现的基因表达调控分子有着重要的功能。
过表达所要研究的目的基因,并观察其产生的表型,是探索基因功能的一个不可或缺的方法。对于microRNA,过表达的方式目前主要有:转染人工合成的microRNA类似物或microRNA茎环前体;克隆基因组中的microRNA编码序列到过表达载体中再转染细胞。人工合成的类似物或是前体虽然可以特异性地提高细胞中的某个microRNA的表达,但是,它只能实现瞬时表达,随着细胞的增殖,其过表达水平会被稀释,难以应用到需要长时间稳定表达的研究,更难以实现体内研究。通过质粒过表达的方式,尤其是通过病毒载体进行的过表达,可以实现稳定过表达,并且转染容易,能实现体内功能的研究。
但是,目前的microRNA过表达质粒的构建,依赖于克隆基因组中的microRNA编码序列(通常将pre-microRNA的全部序列同其上下游各一、两百个碱基一并克隆)。每个microRNA基因经过转录、加工,理论上最终都能够产生两种具有不同成熟序列的成熟体microRNA:5p-microRNA和3p-microRNA[5]。在生理条件下,对不同的microRNA,这两种成熟序列会以其中的一种为主进行表达(称为miR-X),而另外的一种却被淘汰降解丰度很低(称为miR-X*);有时则会两种序列共同表达并存在(分别称为miR-X-5p和miR-X-3p)[6]。由于现有的质粒过表达策略是模拟细胞内部的microRNA转录和成熟的过程,而这一过程对成熟体序列有天然的选择性,所以,不能大量地过表达水平低的miR-X*,也不能随心所欲地单一过表达其中的一条成熟体序列(针对miR-X-5p和miR-X-3p的情况)。
然而,随着研究深入,microRNA的功能不仅局限于早期所鉴定的表达量丰富的成熟体序列,有越来越多的研究表明,原来被认为表达丰度低的成熟体序列,在特定的条件下表达会被上调,进而发挥调节功能[7,8]。同时,由于5p-microRNA和3p-microRNA的序列差异,其功能往往是不同的。
因此,在原有质粒过表达优势的基础上,通过新的策略,单一地过表达microRNA成熟体序列中的一种,势必为今后更精细的研究microRNA的功能提供了一个强有力的工具。
发明内容
本发明的目的在于提供过表达单一MicroRNA成熟体序列的新方法。
在本发明的第一方面,提供一种表达单一microRNA成熟体的方法,所述方法包括:
(1)提供一种表达构建物,所述的表达构建物含有以下结构:
5’Seq正向-Y-Seq反向3’ (I);
其中,Seq反向为该单一microRNA成熟体相应的DNA序列;Seq正向为与Seq反向互补的序列;Y为位于Seq正向和Seq反向之间的间隔序列,并且所述间隔序列与Seq正向和Seq反向不互补;式I所示的结构可形成如下所示的二级结构:
其中,“|”表示在Seq正向和Seq反向中,相应的核苷酸是配对的,在Seq正向和Seq反向之间形成氢键;表示在Seq正向和Seq反向中,相应的核苷酸不配对;并且,“|”和的分布构成了Seq反向与Seq正向的互补;
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