[发明专利]一种FGFR3基因突变检测特异性引物和液相芯片有效
| 申请号: | 201110299592.8 | 申请日: | 2011-09-30 |
| 公开(公告)号: | CN103031364A | 公开(公告)日: | 2013-04-10 |
| 发明(设计)人: | 许嘉森;刘志明 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香 |
| 地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 fgfr3 基因突变 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种FGFR3基因突变检测液相芯片,其特征是,包括有:
(A).针对FGFR3基因不同突变位点分别设计的野生型和突变型的ASPE引物:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变位点的特异性引物序列组成,所述特异性引物序列为:针对R248C位点的SEQ ID NO.22及SEQ ID NO.23;针对G370C位点的SEQ ID NO.24及SEQ ID NO.25;针对S371C位点的SEQ ID NO.26及SEQ ID NO.27;针对Y373C位点的SEQID NO.28及SEQ ID NO.29;针对G380R位点的SEQ ID NO.30及SEQ ID NO.31;针对A391E位点的SEQ ID NO.32及SEQ ID NO.33;针对D641N位点的SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35;针对K650Q/E/T/M位点的SEQ ID NO.36以及选自SEQ ID NO.37、SEQ ID NO.38、SEQ IDNO.39、SEQ ID NO.40中的一种以上;和/或针对G697C位点的SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42,所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.21;
(B).有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.43~SEQ ID NO.63,且所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对;
(C).用于扩增出需要检测的、具有相应突变位点的目标序列的引物。
2.根据权利要求1所述的FGFR3基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为:针对R248C位点的SEQ ID NO.64及SEQ ID NO.65;针对G370C、S371C、Y373C、G380R、A391E位点的SEQ ID NO.66及SEQ ID NO.67;针对D641N、K650Q/E/T/M位点的SEQ ID NO.68及SEQ ID NO.69;和/或针对G697C位点的SEQ ID NO.70及SEQ ID NO.71。
3.根据权利要求1所述的FGFR3基因突变检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物为:针对R248C位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.22组成的序列及由SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.23组成的序列;针对G370C位点的由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.24组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.25组成的序列;针对S371C位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.26组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.27组成的序列;针对Y373C位点的由SEQ ID NO.7和SEQ IDNO.28组成的序列及由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.29组成的序列;针对G380R位点的由SEQ IDNO.9和SEQ ID NO.30组成的序列及由SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.31组成的序列;针对A391E位点的由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.32组成的序列及由SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.33组成的序列;针对D641N位点的由SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.34组成的序列及由SEQ ID NO.14和SEQ ID NO.35组成的序列;针对K650Q/E/T/M位点的由SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.36组成的序列以及选自由SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.37组成的序列、由SEQ ID NO.17和SEQ IDNO.38组成的序列、由SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.39组成的序列、由SEQ ID NO.19和SEQ IDNO.40组成的序列中的一种以上;和/或针对G697C位点的由SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.41组成的序列及由SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.42组成的序列。
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