[发明专利]检测洋葱腐烂病菌的核苷酸序列和试剂盒有效
申请号: | 201110168198.0 | 申请日: | 2011-06-21 |
公开(公告)号: | CN102230015A | 公开(公告)日: | 2011-11-02 |
发明(设计)人: | 高文娜;王中康;周琦;黄魁建;汪万春;李建光;李子龙;江丽辉;吕玉峰;边勇;王文静;邓丛良;梁新苗 | 申请(专利权)人: | 北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 北京正理专利代理有限公司 11257 | 代理人: | 李超 |
地址: | 100026*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 洋葱 腐烂 病菌 核苷酸 序列 试剂盒 | ||
1.检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR检测引物,其特征在于:为序列表SEQ ID No.1和SEQ ID No.2的寡核苷酸序列。
2.检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR探针,其特征在于:为序列表SEQ ID No.3的寡核苷酸序列。
3.根据权利要求2所述的检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR探针,其特征在于:所述探针的5’端连接荧光报告基团FAM,3’端连接荧光淬灭基团BHQ1。
4.检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:该试剂盒含有检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR检测引物和检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR探针;所述检测引物为序列表SEQ ID No.1和SEQ ID No.2的寡核苷酸序列,所述探针为序列表SEQ ID No.3的寡核苷酸序列,探针的5’端连接荧光报告基团FAM,3’端连接荧光淬灭基团BHQ1。
5.检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR试剂盒,其特征在于由以下组分组成:
(1)PCR反应液:由2×反应液Premix EX Taq、引物PBAF、引物PBAR和探针组成;其中,引物PBAF为序列表SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,引物PBAR为序列表SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列,探针为序列表SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列,探针5′端标记报告荧光染料FAM,3′端标记淬灭荧光染料BHQ1;
(2)无DNA酶的灭菌纯化水;
(3)阴性对照:1mL×1管;研磨无菌健康洋葱鳞球茎,用0.01mol/L pH7.2 PBS缓冲盐溶液制成20%悬液,121℃灭活30min;
(4)阳性对照:1mL×1管;为含有洋葱腐烂病菌Bga核糖体基因保守区序列SEQ ID NO.4的重组质粒,Ct值为22.0~28.0。
6.根据权利要求5所述的检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:所述反应液Premix EX Taq的终浓度为1×,引物PBAF的终浓度为0.3uM、引物PBAR的终浓度为 0.3uM,探针的终浓度为0.1uM。
7.根据权利要求5所述的检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:所述阳性对照的制备方法为:用SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的引物序列对洋葱腐烂病菌进行PCR反应,回收PCR扩增产物,获得高纯度的138 bp 核糖体基因保守区序列SEQ ID No.4,与pGEM-T easy载体进行连接,转化E.coli Competent Cells DH5α感受态细胞,使用Takara MiniBEST Plasmid Purification Kit Ver 2.0质粒提取试剂盒提取DNA,经PCR和酶切鉴定后获得阳性重组质粒作为阳性对照,命名为pGEM-Bga;10倍连续梯度稀释裂解液,测定Ct值,Ct值为22.0~28.0者作为阳性对照。
8.根据权利要求5或6或7所述的检测洋葱腐烂病菌的荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:该试剂盒还含有(5)细菌基因组DNA提取试剂盒。
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