[发明专利]一种检测宫颈癌血浆Bmi-1 mRNA的专用试剂盒及方法有效
申请号: | 201110167829.7 | 申请日: | 2011-06-21 |
公开(公告)号: | CN102230014A | 公开(公告)日: | 2011-11-02 |
发明(设计)人: | 王传新;张欣 | 申请(专利权)人: | 山东大学齐鲁医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 杨琪 |
地址: | 250014 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 宫颈癌 血浆 bmi mrna 专用 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测宫颈癌血浆Bmi-1 mRNA的专用试剂盒,其特征在于:包括Bmi-1基因、GAPDH基因和EEF1A1基因的mRNA的引物,引物序列如下所示:
Bmi-1-F:5’-GAGCGTACTACATTGATGTCACAAC-3’;
Bmi-1-R:5’-GCTGGTCTCCAGGTCGCGAACAATA-3’;
GAPDH-F:5’-TGCACCACGAACTGCTTAGC-3’;
GAPDH-R:5’-GGCATGGACTGTTATCATGAG-3’;
EEF1A1-F:5’-CTGGCAAGTCCACCAAGTCT-3’;
EEF1A1-R:5’-CCGTTCTTCACCCACTGATT-3’。
2.根据权利要求1所述的检测宫颈癌血浆Bmi-1 mRNA的专用试剂盒,其特征在于:还包括PCR反应液,PCR反应液由Syber Green I荧光染料、DNA聚合酶、dNTPs、三羟甲基氨基甲烷盐酸盐、氯化钾和氯化镁组成。
3.根据权利要求2所述的检测宫颈癌血浆Bmi-1 mRNA的专用试剂盒,其特征在于:所述上游引物和下游引物的体积均为1μl,其中,Bmi-1-F、Bmi-1-R、GAPDH-F、GAPDH-R、EEF1A1-F和EEF1A1-R的浓度均为10μM;所述PCR反应液中,各组分的浓度为:DNA聚合酶的浓度为100U/ml,dNTPs的浓度为0.2mM,三羟甲基氨基甲烷盐酸盐的浓度为16.5mM,氯化镁的浓度为6mM,氯化钾的浓度为89.3mM和1×Syber Green I荧光染料。
4.一种检测宫颈癌血浆Bmi-1 mRNA表达量的方法,其特征在于,步骤如下:
(1)提取样本血浆的总RNA;
(2)RT-PCR扩增:将上述提取的mRNA进行反转录成cDNA,取cDNA为模板,加入引物和PCR反应液,进行PCR反应,检测样本阈值Cq(test sample);同时以宫颈癌细胞株Hela细胞中提取mRNA,逆转录成cDNA作为校对样本,在每个PCR反应板中进行检测;
(3)制作标准曲线:从宫颈癌细胞株Hela细胞中提取mRNA,逆转录成cDNA,梯度稀释后,作为标准品,同步骤(2)进行RT-PCR扩增,检测CT值;然后拷贝数以10为底取对数作为横坐标,CT值为纵坐标作图,给出数据点的趋势线,制作标准曲线,计算斜率slope,然后根据公式E=10(-1/slope)-1,计算扩增效率E;
(4)计算:选中样本和校对样本检测孔,应用实时荧光定量PCR仪的随机软件得出样本阈值Cq(test sample)和校对样本阈值Cq(calibrator sample),根据公式Q=(E+1)-ΔCq,ΔCq=[Cq(test sample)-Cq(calibrator sample)],得出基因的校正起始拷贝数Q;将样本目的基因Bmi-1的Q值与内参基因GAPDH基因和EEF1A1的Q值的几何平均数相比,得到目的基因Bmi-1的相对表达量。
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