[发明专利]一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法有效
| 申请号: | 201110156577.8 | 申请日: | 2011-06-10 |
| 公开(公告)号: | CN102230007A | 公开(公告)日: | 2011-11-02 |
| 发明(设计)人: | 赵晓祥;白舟;李颢;邵姗珊;谢佳 | 申请(专利权)人: | 东华大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达;谢文凯 |
| 地址: | 201620 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 分子 信标 荧光 定量 pcr 检测 邻苯二 甲酸 方法 | ||
技术领域
本发明属于邻苯二甲酸酯的检测领域,特别涉及一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法。
背景技术
邻苯二甲酸酯(PAEs)是塑料的增塑剂,是世界上生产量大,应用面广的人工合成有机化合物,它广泛应用于塑料工业。这类污染物已大量进人环境,普遍存在于土壤、底泥、水体、生物、空气及大气降尘物等环境样品中。由于PAEs的广泛存在,其对环境的影响渐渐凸显。研究证明,PAEs具有急性毒性、致癌性和致畸性等多种生物毒性。环境行为和生态效应研究表明,邻苯二甲酸酯水解和光解速率都非常缓慢,已成为一种全球性的环境有机污染物,被中国环境检测总站和美国EPA列为优先控制污染物。
关于邻苯二甲酸酯的检测有气相色谱法、液相色谱法、气相色谱-质谱法(GC-MS)、荧光法等。用色谱法检测不但昂贵费时,而且分析过程繁琐冗长。近年来,随着生物技术的发展产生了许多邻苯二甲酸酯的生物检测方法。
荧光定量PCR是近年来出现的具有高灵敏度的定量PCR方法。PAEs于细胞质中的雌激素结合后,进一步与结合DNA复合后,形成PCR扩增的模板。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,该方法具有灵敏度高,检出限低,特异性强的特点,可用于快速检测大批量样本中的邻苯二甲酸酯的含量,具有良好的应用前景。
本发明的一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,包括:
(1)将喂养于含邻苯二甲酸酯的水中的鲤鱼杀死并取出肝脏,用KCl溶液洗去血液,吸干水分,加入体积与肝脏质量比为4mL∶1g的HEDG缓冲液匀浆,离心取上清,即得含有受体的细胞溶质;
(2)将pUC19质粒稀释50倍作为模板,PCR扩增制得结合DNA,将结合DNA于琼脂糖凝胶电泳分离,最后纯化回收;
(3)将邻苯二甲酸酯倍比稀释为10-1g/L-10-9g/L,取10μL与250μL的细胞溶质混合,于20℃振荡温育2h;
(4)从上述混合物中取20μL加入1.5mLEP管中,20℃温育15min后,再加入2μL结合DNA,继续20℃温育15min得配体-受体-DNA复合物;从复合物中取12μL再加入2μL ExoIII(核酸外切酶III)缓冲液和6μL HEDG缓冲液,混匀后37℃温育15min,再加入ExoIII100U,混匀后37℃温育15min进行初次消解;取经初步消解的溶液5μL,加入15μL S1核酸酶混合液,于37℃温育30min进行再次消解;再加入1μL S1核酸酶停止液,70℃灭活15min;得到分子信标PCR的模板;
(5)以上述模板进行分子信标荧光定量PCR扩增,分子信标PCR循环40次后在72℃延伸5min,得加入邻苯二甲酸酯浓度与起始模板拷贝数的回归方程;其中,引物碱基序列为:上游引物R1:5′CAGGTC AGAGTGACC TGC TTC CTC GCT CAC TG 3′;下游引物R2:5′GTC CAG TCT CAC TGG ACA GGC AAC TAT GGA TG 3′,分子信标探针的序列为:5′FAM-CTTGG CAAGCAGCAGATTACGCCCAAG-DABCYL 3′;
(6)根据结合DNA标准曲线进行线性回归分析,得邻苯二甲酸酯浓度与Ct值关系,测定样品Ct值计算得邻苯二甲酸酯浓度。
所述步骤(1)中的KCl溶液浓度为0.15~0.2mol/L。
所述步骤(2)中的PCR扩增引物碱基序列为上游引物F1:5′CAG GTC AGA GTG ACC TGC TTC CTC GCT CAC TG 3′,下游引物F2:5′GTC CAG TCT CAC TGGACA GGC AAC TAT GGATG 3’。
所述步骤(2)中的琼脂糖凝胶质量百分比浓度为1%。
所述步骤(4)中的S1核酸酶停止液含0.3mol/L的Tris碱和1.35mol/L的EDTA。
所述步骤(5)中的分子信标荧光定量PCR扩增体系为:每50μl体系中包括含25μmol/LMgCl2的反应缓冲液5μL、1.25mmol/L dNTP 4μL、50μmol/L上下游引物各0.2μL、TaqDNA聚合酶0.3μL、探针0.3μL、模板5μL和灭菌双蒸水35.8μL,TaqDNA聚合酶浓度为3U/μl。
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