[发明专利]一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法有效
| 申请号: | 201110156577.8 | 申请日: | 2011-06-10 |
| 公开(公告)号: | CN102230007A | 公开(公告)日: | 2011-11-02 |
| 发明(设计)人: | 赵晓祥;白舟;李颢;邵姗珊;谢佳 | 申请(专利权)人: | 东华大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达;谢文凯 |
| 地址: | 201620 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 分子 信标 荧光 定量 pcr 检测 邻苯二 甲酸 方法 | ||
1.一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,包括:
(1)将喂养于含邻苯二甲酸酯的水中的鲤鱼杀死并取出肝脏,用KCl溶液洗去血液,吸干水分,加入体积与肝脏质量比为4mL∶1g的HEDG缓冲液匀浆,离心取上清,即得含有受体的细胞溶质;
(2)将pUC19质粒稀释50倍作为模板,PCR扩增制得结合DNA,将结合DNA于琼脂糖凝胶电泳分离,最后纯化回收;
(3)将邻苯二甲酸酯倍比稀释为10-1g/L-10-9g/L,取10μL与250μL的细胞溶质混合,于20℃振荡温育2h;
(4)从上述混合物中取20μL加入1.5mLEP管中,20℃温育15min后,再加入2μL结合DNA,继续20℃温育15min得配体-受体-DNA复合物;从复合物中取12μL再加入2μL ExoIII buffer和6μL HEDG缓冲液,混匀后37℃温育15min,再加入ExoIII100U,混匀后37℃温育15min进行初次消解;取经初步消解的溶液5μL,加入15μL S1核酸酶混合液,于37℃温育30min进行再次消解;再加入1μL S1核酸酶停止液,70℃灭活15min;得到分子信标PCR的模板;
(5)以上述模板进行分子信标荧光定量PCR扩增,分子信标PCR循环40次后在72℃延伸5min,得加入邻苯二甲酸酯浓度与起始模板拷贝数的回归方程;其中,引物碱基序列为:上游引物R1:5′CAGGTC AGAGTGACC TGC TTC CTC GCT CAC TG 3′;下游引物R2:5′GTCCAG TCT CAC TGG ACA GGC AAC TAT GGA TG 3′,分子信标探针的序列为:5′FAM-CTTGG CAAGCAGCAGATTACGCCCAAG-DABCYL 3′;
(6)根据结合DNA标准曲线进行线性回归分析,得邻苯二甲酸酯浓度与Ct值关系,测定样品Ct值计算得邻苯二甲酸酯浓度。
2.根据权利要求1所述的一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,其特征在于:所述步骤(1)中的KCl溶液浓度为0.15~0.2mol/L。
3.根据权利要求1所述的一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,其特征在于:所述步骤(2)中的PCR扩增引物碱基序列为上游引物F1:5′CAG GTC AGA GTG ACC TGC TTC CTC GCT CAC TG 3′,下游引物F2:5′GTC CAG TCT CAC TGG ACA GGC AAC TAT GGA TG 3′。
4.根据权利要求1所述的一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,其特征在于:所述步骤(2)中的琼脂糖凝胶质量百分比浓度为1%。
5.根据权利要求1所述的一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,其特征在于:所述步骤(4)中的S1核酸酶停止液含0.3mol/L的Tris碱和1.35mol/L的EDTA。
6.根据权利要求1所述的一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,其特征在于:所述步骤(5)中的分子信标荧光定量PCR扩增体系为:每50μl体系中包括含25μmol/L MgCl2的反应缓冲液5μL、1.25mmol/L dNTP 4μL、50μmol/L上下游引物各0.2μL、TaqDNA聚合酶0.3μL、探针0.3μL、模板5μL和灭菌双蒸水35.8μL,TaqDNA聚合酶浓度为3U/μl。
7.根据权利要求1所述的一种分子信标荧光定量PCR检测邻苯二甲酸酯的方法,其特征在于:所述步骤(5)中的分子信标PCR循环步骤为94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min。
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