[发明专利]荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的引物、探针及试剂盒有效
申请号: | 201110103579.0 | 申请日: | 2011-04-25 |
公开(公告)号: | CN102181583A | 公开(公告)日: | 2011-09-14 |
发明(设计)人: | 刘兴友;刘明成;王丽荣;胡建和 | 申请(专利权)人: | 河南科技学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64;C12R1/93 |
代理公司: | 郑州大通专利商标代理有限公司 41111 | 代理人: | 樊羿 |
地址: | 453003 河南省新乡*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荧光 定量 rt pcr 检测 鸭源性 冠状病毒 引物 探针 试剂盒 | ||
1.一种荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的引物及探针,其核苷酸序列如下:
上游引物:5'-AGGTAGTGGTGTTCCTGATAATGAG-3’,
下游引物:5'-ACGCATCTGGGACTGGTTTTC-3',
探针引物:5'-CCTGGCTTATACCTGGCTTGGCGTCT-3'。
2.根据权利要求1所述的荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的引物及探针,其特征在于,与所述上、下游引物相对应的鸭源性冠状病毒ZZ2004的DNA特征片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;与所述探针引物相对应的鸭源性冠状病毒ZZ2004的DNA特征片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
3.根据权利要求1所述的荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的引物及探针,其特征在于,所述上游引物和下游引物对鸭源性冠状病毒ZZ2004株RT-PCR扩增出约117bp的产物。
4.权利要求1所述的荧光定量RT-PCR检测引物及探针在对鸭源性冠状病毒ZZ2004的鉴别和定量检测中的应用。
5.一种荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的试剂盒,其特征在于,含有权利要求1所述的所有引物及探针。
6.根据权利要求5所述的荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的试剂盒,其特征在于,含有荧光定量RT-PCR反应体系,以单样份计量,该荧光定量RT-PCR反应体系包括:
RNase Free ddH2O 17.75μL、25μmol/L的dNTP Mixture 1μL、10×PCR Buffer Mg2+ 2.5μL、10μmol/L的上游引物F3 0.25μL、10μmol/L的下游引物F40.25μL、10μmol/L的探针引物0.5μL、5U/μL的 rTaq 0.25μL,且检测时使加入待测样液后的RT-PCR反应体系总体积为25μL。
7.根据权利要求6所述的荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的试剂盒,其特征在于,所述待测样液的制备方法如下:
(1)取相应的待检组织器官,剪碎放入无菌离心管中,按1g:5mL的比例加入经高压灭菌PBS缓冲液, -20℃下反复冻融2~3次,1000rpm离心5~8min;弃沉淀,取上清于另一无菌离心管中,8000rpm离心8~12min;弃沉淀,取上清于另一无菌离心管中,12000rpm离心8~12min;弃沉淀,取上清于另一无菌离心管中,用0.22μm的滤器过滤,得滤液;
(2)用RNA提取试剂提取RNA,再进行一步法反转录反应,反应体系为:5×Buffer 2μL、 Enzzyme Mix 0.5μL、Random 6 mers 0.5μL、Oligo dT primer 0.5μL、Totall RNA 5μL、RNase Free ddH20 1.5μL,总体积为10μL,反应条件为:37℃、15min,85℃、5s。
8.根据权利要求6所述的荧光定量RT-PCR检测鸭源性冠状病毒的试剂盒,其特征在于,以所述试剂盒对待测样液进行TaqMan荧光定量RT-PCR扩增时的反应条件为:
94℃ 30s,
94℃ 10s 60℃ 1min 40 cycle。
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