[发明专利]咽拭子标本手足口病EV71病毒real-time RT-PCR检测试剂盒及其检测方法有效

专利信息
申请号: 201110099249.9 申请日: 2011-04-20
公开(公告)号: CN102559924A 公开(公告)日: 2012-07-11
发明(设计)人: 刘胜牙;朱玉兰;王佃鹏;叶健忠;叶卫翔;甄胜西;黄彤文 申请(专利权)人: 深圳国际旅行卫生保健中心
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64
代理公司: 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 11003 代理人: 尹振启
地址: 518033 广东省深*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 咽拭子 标本 手足 ev71 病毒 real time rt pcr 检测 试剂盒 及其 方法
【权利要求书】:

1.咽拭子标本手足口病EV71病毒real-time RT-PCR检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒的引物和探针序列如下:

lsy-VFP2:5’-TGACGAGAGCATGATTGAGACA-3’;

lsy-VRP2:5’- CCGCRCTGCTGAAGAAACTA -3’;

lsy-Probe2:5’- CTTAACTCGCACAGYACAGCTGAGACCAC -3’。

2.咽拭子标本手足口病EV71病毒real-time RT-PCR检测方法,其特征在于,该检测方法具体为:

1)根据EV71病毒基因序列,设计引物和探针序列如下:

lsy-VFP2:5’-TGACGAGAGCATGATTGAGACA-3’;

lsy-VRP2:5’- CCGCRCTGCTGAAGAAACTA -3’;

lsy-Probe2:5’- CTTAACTCGCACAGYACAGCTGAGACCAC -3’;

2)提取待测样品RNA;

3)以待测样品RNA为模板,在包括步骤1)所述引物和探针序列的RT PCR反应体系中进行RT PCR反应;

4)采用实时PCR检测仪进行PCR扩增及结果分析,通过荧光定量检测,根据荧光检测的最低Ct值和最高荧光强度判断结果,荧光RT PCR反应呈阳性,则待测样品含有EV71病毒核酸。

3.如权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述待测样品为咽拭子标本,所述待测样品RNA采用QIAGEN病毒RNA提取试剂盒提取。

4.如权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述RT PCR反应体系为:2×One Step RT-PCR Buffer Ⅲ 12.5μl ,TaKaRa Ex Taq? HS  5 U/μl  0.5μl,PrimeScript? RT Enzyme Mix Ⅱ0.5 μl ,RNase Free dH2O  4.5 μl,ROX Reference Dye II  50×  0.5μl ,Primer  40μmol/L  各0.5μl,Probe  10μmol/L 0.5 μl。

5.如权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述RT PCR反应的反应条件为:42℃8min;95℃10s;95℃5s;58℃34s,45 Cycles;退火温度按54℃、56℃、58℃、60℃分别试验优化,退火温度为58度时,反应曲线呈典型的S型,荧光信号最强,本方法选择58度作为退火温度进行所述RT PCR反应。

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