[发明专利]咽拭子标本手足口病EV71病毒real-time RT-PCR检测试剂盒及其检测方法有效
| 申请号: | 201110099249.9 | 申请日: | 2011-04-20 |
| 公开(公告)号: | CN102559924A | 公开(公告)日: | 2012-07-11 |
| 发明(设计)人: | 刘胜牙;朱玉兰;王佃鹏;叶健忠;叶卫翔;甄胜西;黄彤文 | 申请(专利权)人: | 深圳国际旅行卫生保健中心 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;G01N21/64 |
| 代理公司: | 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 11003 | 代理人: | 尹振启 |
| 地址: | 518033 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 咽拭子 标本 手足 ev71 病毒 real time rt pcr 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.咽拭子标本手足口病EV71病毒real-time RT-PCR检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒的引物和探针序列如下:
lsy-VFP2:5’-TGACGAGAGCATGATTGAGACA-3’;
lsy-VRP2:5’- CCGCRCTGCTGAAGAAACTA -3’;
lsy-Probe2:5’- CTTAACTCGCACAGYACAGCTGAGACCAC -3’。
2.咽拭子标本手足口病EV71病毒real-time RT-PCR检测方法,其特征在于,该检测方法具体为:
1)根据EV71病毒基因序列,设计引物和探针序列如下:
lsy-VFP2:5’-TGACGAGAGCATGATTGAGACA-3’;
lsy-VRP2:5’- CCGCRCTGCTGAAGAAACTA -3’;
lsy-Probe2:5’- CTTAACTCGCACAGYACAGCTGAGACCAC -3’;
2)提取待测样品RNA;
3)以待测样品RNA为模板,在包括步骤1)所述引物和探针序列的RT PCR反应体系中进行RT PCR反应;
4)采用实时PCR检测仪进行PCR扩增及结果分析,通过荧光定量检测,根据荧光检测的最低Ct值和最高荧光强度判断结果,荧光RT PCR反应呈阳性,则待测样品含有EV71病毒核酸。
3.如权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述待测样品为咽拭子标本,所述待测样品RNA采用QIAGEN病毒RNA提取试剂盒提取。
4.如权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述RT PCR反应体系为:2×One Step RT-PCR Buffer Ⅲ 12.5μl ,TaKaRa Ex Taq? HS 5 U/μl 0.5μl,PrimeScript? RT Enzyme Mix Ⅱ0.5 μl ,RNase Free dH2O 4.5 μl,ROX Reference Dye II 50× 0.5μl ,Primer 40μmol/L 各0.5μl,Probe 10μmol/L 0.5 μl。
5.如权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述RT PCR反应的反应条件为:42℃8min;95℃10s;95℃5s;58℃34s,45 Cycles;退火温度按54℃、56℃、58℃、60℃分别试验优化,退火温度为58度时,反应曲线呈典型的S型,荧光信号最强,本方法选择58度作为退火温度进行所述RT PCR反应。
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