[发明专利]大白菜叶绿体来源的小RNA及其热响应作用有效
| 申请号: | 201110074305.3 | 申请日: | 2011-03-25 |
| 公开(公告)号: | CN102690820A | 公开(公告)日: | 2012-09-26 |
| 发明(设计)人: | 何玉科;王璐;孙传宝;于祥;王晗 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12N15/10 |
| 代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陈静 |
| 地址: | 200031 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 大白菜 叶绿体 来源 rna 及其 响应 作用 | ||
1.一种筛选具有热响应作用的小RNA的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)将2-4周大小的热敏感白菜苗在46±0.5℃热处理1±0.1小时,作为热处理组;以未经热处理的2-4周大小的热敏感白菜苗作为对照组;
(2)分别提取热处理组和对照组白菜苗的RNA,分别获得热处理组和对照组的小RNA测序数据库,其中小RNA序列的长度为9-36nt;
(3)比较热处理组的小RNA测序数据库与对照组的小RNA测序数据库的序列信息,从热处理组的小RNA测序数据库中分离出相对于对照组的小RNA序列丰度显著下降2倍以上的小RNA序列,其即为具有热响应作用的小RNA。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的小RNA包括mRNA,rRNA,tRNA或基因间RNA。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,将2.5-3.5周大小的热敏感白菜苗在46±0.2℃热处理1±0.05小时,作为热处理组;以未经热处理的2.5-3.5周大小的热敏感白菜苗作为对照组。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,在分别提取热处理组和对照组白菜苗的RNA,还包括步骤:测序并分离出叶绿体相关的RNA序列。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,通过BLAST分析,将所述的RNA与叶绿体基因组序列进行匹配,从而分离出叶绿体相关的RNA序列。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,通过Northern blot方法进一步验证小RNA的表达情况。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,非热处理的阶段,所述的热敏感白菜在常温下培养。
8.如权利要求7所述的方法,其特征在于,所述的常温是22±3℃。
9.一种分离的小RNA,其是通过权利要求1-8任一所述的方法获得的。
10.如权利要求9所述的小RNA,其特征在于,所述的小RNA具有选自SEQID NO:1,SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列。
11.权利要求9或10所述的小RNA的用途,用于响应热信号,参与植物的抗热反应。
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