[发明专利]一种柯萨奇病毒A16_3C蛋白酶的结构及其应用有效
| 申请号: | 201110066257.3 | 申请日: | 2011-03-18 |
| 公开(公告)号: | CN102181418A | 公开(公告)日: | 2011-09-14 |
| 发明(设计)人: | 高福;逯光文 | 申请(专利权)人: | 中国科学院微生物研究所 |
| 主分类号: | C12N9/50 | 分类号: | C12N9/50;G06F19/16;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京汇信合知识产权代理有限公司 11335 | 代理人: | 王秀丽 |
| 地址: | 100101 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 柯萨奇 病毒 a16_3c 蛋白酶 结构 及其 应用 | ||
1.一种柯萨奇病毒A16_3C蛋白酶的结构,其特征在于其氨基酸组成如(a)或(b)或(c)的蛋白质:
(a)有SEQ ID NO.1所示的氨基酸组成的蛋白质,
(b)在(a)中的氨基酸序列经过取代、缺失或添加一个氨基酸或几个氨基酸且具有3C蛋白酶活性的由(a)衍生的蛋白质;
(c)与(a)中氨基酸序列整体相似度在85%以上,并且在R39,K130,H24,Q19,E107和H108等六个位置上氨基酸完全保守的由(a)衍生的蛋白质。
2.权利要求1所述蛋白酶的结构在药物设计中的应用。
3.权利要求2所述的应用,其特征在于应用于药物的分子设计。
4.权利要求1所述蛋白酶的底物结合槽,包括S2和S1’结合位点,其特征在于其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
5.根据权利要求4所述底物结合槽,其特征在S2位点为半封闭的槽状结构,S1’位点的容积显著变小。
6.权利要求4所述底物结合槽在药物设计中的应用。
7.权利要求6所述的应用,其特征在于应用于药物的分子设计。
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