[发明专利]一种凋落物总DNA的提取方法无效
申请号: | 201110062434.0 | 申请日: | 2011-03-15 |
公开(公告)号: | CN102676496A | 公开(公告)日: | 2012-09-19 |
发明(设计)人: | 隋心;韩士杰;冯富娟 | 申请(专利权)人: | 中国科学院沈阳应用生态研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 许宗富;周秀梅 |
地址: | 110164 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 凋落 dna 提取 方法 | ||
技术领域
本发明涉及凋落物分子生物学,具体的说是一种凋落物总DNA的提取方法。
背景技术
随着DNA分子标记技术和重组DNA技术的发展,制备完整、纯度高的基因组DNA日益显得重要。我们在进行一个物种DNA水平上的研究时,首先遇到的问题就是如何快速、简单、成本不高的获得较完整、纯度较高的基因组DNA。由于植物细胞与动物细胞不同,具有一层坚硬的细胞壁,且含有较多的多糖、色素、脂质和多酚等物质,给植物DNA提取带来很多困难,特别是多糖和多酚类物质不容易与DNA分开。相对于植物新鲜样品,凋落物中植物的次生代谢产物类含量更高,高质量基因组DNA提取更难。为了去除多糖类物质对后续研究的干扰,过去采用费事且价格昂贵的氯化铯密度梯度离心技术(Murray M G,Thompson W F.Rapid isolation of high molecular weight plant DNA[J].Nucleic Acids Res.,1980,8(19):4321-4325.)。从上世纪90年代以来,很多的文献报道过利用CTAB法提取植物基因组DNA(李希臣,雷学钧,卢翠花,等.高效的植物DNA提取方法[J].生物技术,1994,4(3):39-41.;卢扬江,郑康乐.提取水稻DNA的一种简易方法[J].中国水稻科学,1992,6(1):47-48.;邹喻苹,汪小全,雷一丁,等.几种濒危植物及其近缘类群总DNA的提取与鉴定[J].植物学报,1994,36(7):528-533.;Cheng FS,Brown SK,Weeden N F.ADNA extraction protocol from various tissues in woody species[J].HortScience,1997,32(5):921-922.;Edwards K,Johnstone C,Thomson J.A simple and rapid method for the preparation of plant genomie DNA for PCR analysis[J].Nucleic Acids Res,1991,19(6):1349.;Thomson D,Henry R.Use of DNA from dry leaves for PCRand RAPDanalysis[J].Plant Molecular Biology Reporter,1993,11(3):202-206.;王军,贺普超.山葡萄基因组DNA提取及RAPD鉴定[J].果树科学,2000,17(2):79-82.),所提取的DNA可用于RAPD,ISSR等标记研究。但是对于凋落物基因组DNA的提取未见报道。
发明内容
本发明目的在于提供一种凋落物总DNA的提取方法。
为实现上述目的,本发明采用技术方案为:
1)将已研成粉末、预冷的凋落物加入于CTAB提取缓冲液中混匀(1g~2g粉末加入500ul~650μLCTAB),于64-66℃水浴5-10min;而后以12000-13000r·min-1离心5-10min,收集沉淀,待用;
2)将步骤1)所得沉淀加入到过量的CTAB提取缓冲液混匀,64-66℃水浴5-10min,待用;
3)将步骤2)水浴后沉淀抽提2-4次,抽提过程为将沉淀加入等量的氯仿-异戊醇中混匀,以12000-13000r·min-1离心5-10min,收集上清液;
4)将步骤3)抽提后上清液中加入上清液2-2.5体积的预冷无水乙醇和上清液0.2-0.3倍体积的NaAC混匀,静止放置15-30min,而后以10000-12000r·min-1离心5-10min,所得沉淀,即为凋落物总DNA。
所述步骤4)所得凋落物总DNA采用70%(体积分数)乙醇洗涤而后室温干燥,将干燥DNA沉淀溶于去离子水中保存。
所述步骤1)凋落物于-40℃或-20℃冰箱冷冻,而后将其于液氮中研成粉末。所述步骤1)和2)水浴时每隔2分钟颠倒混匀缓冲液,所述步骤3)中氯仿-异戊醇,按体积比为24∶1混匀。
凋落物是指未经化学处理的森林凋落物,包括各种腐叶、树叶。
本发明所具有的优点:
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