[发明专利]人乳腺癌基因分型实时荧光定量PCR检测方法无效
申请号: | 201110061529.0 | 申请日: | 2011-03-15 |
公开(公告)号: | CN102676641A | 公开(公告)日: | 2012-09-19 |
发明(设计)人: | 彭金彪;陈晶;陆敬舟;程朝平 | 申请(专利权)人: | 上海易瑞生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 201203 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳腺癌 基因 实时 荧光 定量 pcr 检测 方法 | ||
1.一种人乳腺癌基因分型实时荧光定量PCR检测方法,其特征在于,所述方法是以人乳腺癌相关基因ERα(SEQ ID 9)、PR(SEQ ID 10)、HER-2(SEQ ID 11)作为扩增的靶基因序列,以18S rRNA(SEQ ID 12)作为内参基因,分别设计与所述ERα、PR、HER-2、18S rRNA基因相对应的特异性引物,采用实时荧光定量PCR方法检测待测样品和对照样品的CT值,计算靶基因表达量;利用ΔΔCT法对靶基因表达量进行分析,所述靶基因表达量=2-ΔΔCT,ΔΔCT= ( CT,target- CT,18S)(detected)- ( CT,target- CT,18S)(control) ;当所述靶基因表达量≤1时,所述ERα、PR、HER-2基因为阴性分型;当所述靶基因表达量>1时,所述ERα、PR、HER-2基因为阳性分型。
2.如权利要求1所述方法,其特征在于,所述方法是以pMD?19-T作为质粒载体,分别以基因片段ERα(SEQ ID 13)、PR(SEQ ID 14)、HER-2(SEQ ID 15)、18S rRNA(SEQ ID 16)构建重组质粒作为标准品。
3.如权利要求1所述方法,其特征在于,与所述ERα基因相对应的引物序列为:
正向:5'- ACCGAAGAGGAGGGAGAATG-3'(SEQ ID 1);
反向:5'- AACAAGGCACTGACCATCTG-3'(SEQ ID 2)。
4.如权利要求1所述方法,其特征在于,与所述PR基因相对应的引物序列为:
正向:5'- TTCACCAGGTCAAGACATACAG-3'(SEQ ID 3);
反向:5'- GTTGCCTCTCGCCTAGTTG-3'(SEQ ID 4)。
5.如权利要求1所述方法,其特征在于,与所述HER-2基因相对应的引物序列为:
正向:5'- TTACCAGTGCCAATATCCAGG -3'(SEQ ID 5);
反向:5'- TCCAGAGTCTCAAACACTTGG -3'(SEQ ID 6)。
6.如权利要求1所述方法,其特征在于,与所述18S rRNA基因相对应的引物序列为:
正向:5'- ATACCGCAGCTAGGAATAATGG-3' (SEQ ID 7);
反向:5'- TCGCTCTGGTCCGTCTTG-3'(SEQ ID 8)。
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