[发明专利]用于检测人乳头瘤病毒的基因型的DNA芯片、含有该芯片的试剂盒及检测HPV的基因型的方法

权利要求书

1.一种用于检测来自样品中的人乳头瘤病毒(HPV)的基因型的DNA芯片，包含：具有选自SEQ ID NO6-SEQ ID NO109的碱基序列的线性寡核苷酸探针。

2.一种用于检测来自样品中的人乳头瘤病毒(HPV)的基因型的DNA芯片，包含：具有选自SEQ ID NO110-SEQ ID NO213的碱基序列的d形寡核苷酸探针。

3.根据权利要求1或2所述的DNA芯片，其中，所述DNA芯片用于同时检测44种HPV的基因型，所述44种HPV包括：作为高危型HPV的HPV-16、HPV-18、HPV-31、HPV-33、HPV-35、HPV-39、HPV-45、HPV-51、HPV-52、HPV-56、HPV-58、HPV-59、HPV-68a、HPV-68b和HPV-82；作为中危型HPV的HPV-26、HPV-53、HPV-66、HPV-67、HPV-69、HPV-70和HPV-73；作为低危型HPV的HPV-6、HPV-11、HPV-34、HPV-40、HPV-42、HPV-43、HPV-44、HPV-54、HPV-55、HPV-61、HPV-62、HPV-72和HPV-81；以及作为其他HPV的HPV-90、HPV-10、HPV-27、HPV-30、HPV-32、HPV-57、HPV-83、HPV-84和HPV-91。

4.根据权利要求3所述的DNA芯片，其中，具有选自SEQ ID NO6-SEQ ID NO97或SEQ ID NO110-SEQ ID NO201的碱基序列的寡核苷酸探针与各个类型HPV所特有的L1基因区域互补结合。

5.根据权利要求3所述的DNA芯片，其中，具有选自SEQ ID NO98-SEQ ID NO105或SEQ ID NO202-SEQ ID NO209的碱基序列的寡核苷酸探针是与存在于全部类型的HPV中的L1基因区域互补结合的通用探针。

6.根据权利要求3所述的DNA芯片，其中，具有选自SEQ ID NO106-SEQ ID NO109或SEQ ID NO210-SEQ ID NO213的碱基序列的寡核苷酸探针与作为阳性对照的β-肌动蛋白基因互补结合。

7.根据权利要求1或2所述的DNA芯片，其中，所述DNA芯片具有8-24个分隔孔，所述探针能够被点在所述分隔孔上。

8.根据权利要求1或2所述的DNA芯片，其中，所述寡核苷酸探针的浓度为至少38pmol。

9.根据权利要求1或2所述的DNA芯片，其中，将C6胺修饰的双脱氧胸腺嘧啶核苷连接到所述寡核苷酸探针上作为接头从而将所述寡核苷酸探针点在SuperAldehyde涂敷载体上。

10.根据权利要求9所述的DNA芯片，其中，所述载体选自载玻片、纸、硝酸纤维素膜、微量培养板孔、塑料、硅、DVD和小珠。

11.根据权利要求1或2所述的DNA芯片，其中，所述样品选自子宫颈拭子、阴道拭子、子宫颈组织、阴茎组织、尿、肛门组织、直肠组织、咽组织、口腔组织和头颈组织。

12.根据权利要求1或2所述的DNA芯片，其中，所述样品选自阴茎癌细胞、尿道癌细胞、肛门癌细胞、头颈癌细胞及它们的癌前细胞。

13.根据权利要求1或2所述的DNA芯片，其中，所述DNA芯片用于确定是否将施用HPV疫苗。

14.一种用于检测人乳头瘤病毒(HPV)基因型的试剂盒，包括：根据权利要求1或2所述的DNA芯片，用于通过PCR扩增靶基因的引物，和用于检测所述经扩增DNA的标记物。

15.根据权利要求14所述的试剂盒，其中，所述引物是具有选自SEQ ID NO1-SEQ ID NO2的碱基序列的用于扩增人β-肌动蛋白基因的引物或者具有选自SEQ ID NO3-SEQ ID NO5的碱基序列的用于扩增HPV L1基因的引物。