[发明专利]用于乳腺癌风险评估的方法有效
| 申请号: | 201080033130.5 | 申请日: | 2010-06-01 |
| 公开(公告)号: | CN102712949A | 公开(公告)日: | 2012-10-03 |
| 发明(设计)人: | D.A.海因兹;B.沃尔泽 | 申请(专利权)人: | 遗传技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 龙淳 |
| 地址: | 澳大利亚*** | 国省代码: | 澳大利亚;AU |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 乳腺癌 风险 评估 方法 | ||
1.一种用于评估人类女性受试者发生乳腺癌表型的总体风险的方法,包括:
进行所述女性受试者的临床风险评估;
进行所述女性受试者的遗传风险评估,其中所述遗传风险评估包括,在来源于所述女性受试者的生物样品中,检测至少两种已知与乳腺癌表型相关的单核苷酸多态性的存在;和
结合所述临床风险评估与所述遗传风险评估,以获得人类女性受试者发生乳腺癌表型的总体风险。
2.一种确定通过临床风险评估所分析的人类女性受试者发生乳腺癌表型的总体风险是否应该重新分类的方法,所述方法包括:
结合所述临床风险评估与遗传风险评估,以获得人类女性受试者发生乳腺癌表型的总体风险,其中所述遗传风险评估包括,在来源于所述女性受试者的生物样品中,检测至少两种已知与乳腺癌表型相关的单核苷酸多态性的存在,和
确定将所述临床风险评估与所述遗传风险评估结合是否引起所述受试者发生乳腺癌表型的总体风险的重新分类。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述方法的净重新分类改进(NRI)大于0.01。
4.根据权利要求2所述的方法,其中所述方法的净重新分类改进(NRI)大于0.05。
5.根据权利要求2所述的方法,其中由所述临床风险评估确定的5年风险在约1.5%~约2%之间。
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述方法的净重新分类改进(NRI)大于0.1。
7.根据权利要求1~6中任一项所述的方法,其中进行所述临床风险评估使用选自Gail模型、Claus模型、Claus表格、BOADICEA、Jonker模型、Claus Extended Formula、Tyrer-Cuzick模型、和Manchester评分系统的模型。
8.根据权利要求1~7中任一项所述的方法,其中进行所述临床风险评估包括从所述女性获得关于以下一种或多种的信息:乳腺癌、导管癌或小叶癌的病史、年龄、第一次月经期的年龄、第一次生育的年龄、乳腺癌的家族史、之前乳腺活检的结果、和人种/种族。
9.根据权利要求7或权利要求8所述的方法,其中所述临床风险评估使用Gail模型获得。
10.根据权利要求1~9中任一项所述的方法,其包括检测至少三种、四种、五种、六种、七种、八种、九种或十种已知与乳腺癌表型相关的单核苷酸多态性的存在。
11.根据权利要求1~9中任一项所述的方法,其包括检测七种、八种、九种或十种已知与乳腺癌表型相关的单核苷酸多态性的存在。
12.根据权利要求1~11中任一项所述的方法,其中所述单核苷酸多态性选自rs2981582、rs3803662、rs889312、rs13387042、rs13281615、rs4415084、和rs3817198、或与其一种或多种处于连锁不平衡的单核苷酸多态性。
13.根据权利要求1~11中任一项所述的方法,其中所述单核苷酸多态性选自rs2981582、rs3803662、rs889312、rs13387042、rs13281615、rs4415084、rs3817198、rs4973768、rs6504950、和rs11249433、或与其一种或多种处于连锁不平衡的单核苷酸多态性。
14.根据权利要求12或权利要求13所述的方法,其包括检测至少三种、四种、五种、六种、七种、八种、九种或十种所述单核苷酸多态性的存在。
15.根据权利要求12或权利要求13所述的方法,其包括检测七种、八种、九种或十种所述单核苷酸多态性的存在。
16.根据权利要求1~15中任一项所述的方法,其中在没有协变量的对数加性模型下,通过逻辑回归单独地检验所述单核苷酸多态性与乳腺癌的相关。
17.根据权利要求1~16中任一项所述的方法,其中对所述单核苷酸多态性结合检测其与乳腺癌的相关。
18.根据权利要求1~17中任一项所述的方法,其中结合所述临床风险评估与所述遗传风险评估包括将所述风险评估相乘。
19.根据权利要求1~18中任一项所述的方法,其中所述女性是高加索人。
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