[发明专利]组蛋白修饰用于癌症的临床诊断和预后无效

专利信息
申请号: 201080025136.8 申请日: 2010-04-14
公开(公告)号: CN102460173A 公开(公告)日: 2012-05-16
发明(设计)人: D·W·道森;S·K·库尔迪斯坦尼;D·B·泽尔格森 申请(专利权)人: 加利福尼亚大学董事会
主分类号: G01N33/574 分类号: G01N33/574;C12Q1/68;G01N33/15;A61P35/00
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 余颖
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 组蛋白 修饰 用于 癌症 临床 诊断 预后
【权利要求书】:

1.一种预测癌症患者对5-FU或另一胸苷酸合酶抑制剂治疗的响应的方法,所述方法包括确定取自所述患者的癌组织样品中H3K4me2、H3K9me2或H3K18ac或其组合的整体组蛋白修饰水平。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,存在所述组蛋白修饰的低水平表明当用5-FU或另一胸苷酸合酶抑制剂治疗时的预后或存活可能性较差,而存在H3K4me2、H3K9me2或H3K18ac的高整体组蛋白修饰水平表明当用5-FU或另一胸苷酸合酶抑制剂治疗时的存活预后较好,其中高水平和低水平之间的界值是基于比较组观察所得整体组蛋白修饰水平的统计分析,所述比较组是用胸苷酸合酶抑制剂治疗的一组已知治疗存活率或预后的癌症患者。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述患者患有淋巴结阴性癌症或正接受5-氟尿嘧啶。

4.如权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,所述组蛋白修饰H3K4me2、H3K9me2或H3K18ac的阳性肿瘤细胞染色用于将患者分成低或高染色,其中低染色分类支持总体存活较差的预后。

5.如权利要求1-3中任一项所述的方法,其特征在于,所述预后基于H3K4me2和H3K18ac两者的组蛋白修饰水平,其中H3K4me2和H3K18ac两者的低组蛋白修饰水平预测较差的存活可能性。

6.如权利要求4所述的方法,其特征在于,所述组蛋白修饰水平由免疫细胞化学或免疫组织化学确定。

7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述选自H3K4me2、H3K9me2与H3K18ac的2种或3种组蛋白修饰的组蛋白修饰水平用于提供所述预后。

8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述癌症是胰腺癌。

9.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述分类是基于组蛋白规则。

10.如权利要求1-9中任一项所述的方法,其特征在于,所述癌症是腺癌。

11.如权利要求10所述的方法,其特征在于,所述癌症是低级或早期癌症。

12.前述权利要求中任一项所述的方法,其特征在于,所述划分组蛋白修饰为较高或较低水平的界值如下:H3K9dime为约≥30%,H3K4me2为约>60%或H3K18ac为约>35染色百分位。

13.一种鉴定癌症患者是否能受益于补充5-FU或其它癌症疗法的组蛋白脱乙酰酶抑制剂施用的方法,所述方法包括确定取自患者的胰腺癌的组织样品中H3K18ac组蛋白修饰的水平,其中所述修饰的水平低将表明组蛋白脱乙酰酶抑制剂会有益,其中低水平和高水平之间的界值是基于获自已知存活率或预后的癌症患者比较组的H3K18ac整体组蛋白修饰水平。

14.如权利要求13所述的方法,其特征在于,选择5-FU和所述抑制剂以治疗患者且所述患者按此治疗或按此诊视。

15.如权利要求13所述的方法,其特征在于,所述癌症是低级或早期癌症。

16.一种治疗胰腺癌患者的方法,所述方法包括:

(a)将取自患者的癌组织与抗体接触,所述抗体脱乙酰结合选自H3K4me2、H3K9me2与H3K18ac的经修饰组蛋白;和

(b)确定所述组织样品中所述经修饰组蛋白的水平与已知结果的比较群体中观察所得水平的比较;从而提供所述癌症的预后;和

(c)当所述预后表明癌症可能具有降低的存活率或对采用胸苷酸合酶抑制剂的治疗无响应时,施用更具攻击性的抗癌疗法代替胸苷酸合酶抑制剂或作为所述抑制剂的补充。

17.如权利要求16所述的方法,其特征在于,所述方法预测癌症复发的可能性。

18.如权利要求16所述的方法,其特征在于,所述胸苷酸合酶抑制剂是5-FU。

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