[发明专利]扩增富含GC的DNA模板的方法有效
| 申请号: | 201080016469.4 | 申请日: | 2010-02-04 |
| 公开(公告)号: | CN102395686A | 公开(公告)日: | 2012-03-28 |
| 发明(设计)人: | G.J.拉萨姆 | 申请(专利权)人: | 奥斯瑞根公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 闵丹 |
| 地址: | 美国得*** | 国省代码: | 美国;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 扩增 富含 gc dna 模板 方法 | ||
1.提高一种或多种DNA聚合酶在至少一种富含GC的DNA模板上的持续合成能力的方法,该方法包括,在含有GC/AT比率大于1的dNTP的水溶液中进行DNA扩增。
2.权利要求1的方法,其中所述GC/AT比率是1.1-25。
3.权利要求1的方法,其中所述GC/AT比率是2.5-10。
4.权利要求1的方法,其中所述富含GC的DNA模板具有至少65%的GC丰度。
5.权利要求1的方法,其中所述富含GC的DNA模板具有至少90%的GC丰度。
6.权利要求1的方法,其中所述富含GC的DNA模板包含由G和C残基组成的二、三、或四核苷酸的至少五个连续重复。
7.权利要求1的方法,其中所述富含GC的DNA模板至少包含FMR1的5’UTR的一部分。
8.权利要求1的方法,其中所述富含GC的DNA模板包含FMR1的5’UTR的CGG重复。
9.权利要求1的方法,其中所述富含GC的DNA模板至少包含FMR2的5’UTR的一部分。
10.权利要求1的方法,其中所述富含GC的DNA模板包含FMR2的5’UTR的CGG重复。
11.权利要求1的方法,其中所述水溶液进一步包含至少一种增强剂。
12.权利要求11的方法,其中所述至少一种增强剂包含甜菜碱、甜菜碱类似物、DMSO、或中性去污剂之至少一种。
13.权利要求11的方法,其中所述至少一种增强剂包含
a.甜菜碱或甜菜碱类似物;和
b.至少一种选自下组的化合物:DMSO、中性去污剂、和7-脱氮-GTP。
14.权利要求1的方法,包括在水溶液中扩增所述富含GC的模板,所述水溶液包含
a.至少一种富含GC的DNA模板;
b.至少一种镁盐;
c.至少一种DNA聚合酶;
d.至少一种缓冲液;和
e.GC/AT比率大于1的dNTP,
并使所述溶液经历至少一个温育期,该期间发生扩增。
15.权利要求14的方法,其中所述水溶液进一步包含至少一种增强剂。
16.权利要求15的方法,其中所述至少一种增强剂包含甜菜碱、甜菜碱类似物、7-脱氮-GTP、DMSO、和中性去污剂之至少一种。
17.权利要求1的方法,其中通过选自SDA、NASBA、LAMP、RCA、或LCR之至少一种的方法来扩增所述至少一种富含GC的模板。
18.权利要求1的方法,进一步包括提供与所述至少一种富含GC的模板退火的至少一种引物。
19.提高一种或多种DNA聚合酶在至少一种富含GC的DNA模板上的持续合成能力的方法,该方法包括,在水溶液中经PCR扩增所述模板,所述水溶液包含:
a.GC/AT比率为2-10的dNTP;
b.至少一种增强剂,选自甜菜碱、DMSO、和中性去污剂;
c.至少一种DNA聚合酶;
d.1.5-2mM的总镁浓度;和
e.0.7-0.9mM的总dNTP浓度;
其中所述至少一种富含GC的模板包含FMR1的5’UTR的CGG重复。
20.权利要求19的方法,其中所述中性去污剂包含TWEEN-20。
21.权利要求19的方法,其中所述PCR生成包含至少200个CGG重复的产物。
22.权利要求19的方法,其中所述PCR生成包含至少300个CGG重复的产物。
23.一种检测与富含GC的三核苷酸重复病症有关的基因型的方法,包括对至少一种与富含GC的重复有关的基因型进行DNA扩增反应,其中通过提供包含GC/AT比率大于1的dNTP的水溶液来提高一种或多种DNA聚合酶的持续合成能力。
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