[发明专利]靶基因组序列富集的方法和系统

权利要求书

1.一种在样品中富集靶核酸序列的方法，所述方法包括：

a)将包含核酸序列的样品施加到第一组杂交探针并让其杂交，其中所述核酸序列包括非靶核酸序列和靶核酸序列，所述杂交探针包含与样品中的非靶核酸序列互补的序列，

b)将包含未杂交靶核酸序列的溶液与已杂交非靶序列分开，

c)将所述包含未杂交靶核酸序列的溶液施加到第二组杂交探针并让其杂交，其中所述第二组杂交探针包含与所述靶核酸序列互补的序列，和

d)从第二组杂交探针上洗脱所述已杂交靶核酸序列，从而富集样品中的靶核酸序列。

2.权利要求1的方法，其中步骤a)和c)发生在固相。

3.权利要求2的方法，其中所述固相是微阵列。

4.权利要求1的方法，其中步骤a)和c)中的至少一步发生在溶液中。

5.一种在包含靶核酸和非靶核酸的样品中富集靶核酸序列的方法，所述方法包括：

a)产生第一组杂交探针，所述探针包含与非靶核酸序列互补的序列；

b)产生第二组杂交探针，所述探针包含与靶核酸序列互补的序列；

c)将第一组探针与所述样品混合，让第一组探针与非靶核酸杂交；

d)从所述样品中移出已杂交的第一组探针，构成包含靶核酸序列的第一富集溶液；

e)将第二组探针与第一富集溶液混合，让第二组探针与靶核酸杂交；

f)移出已杂交的第二组探针；和

g)将靶序列从已杂交的第二组探针上洗脱下来，构成包含靶核酸序列的第二富集溶液。

6.权利要求5的方法，其中步骤c)发生在微阵列上。

7.权利要求5的方法，其中第一组杂交探针在步骤a)中在溶液中产生并且杂交步骤c)发生在溶液中。

8.权利要求7的方法，其中微阵列用于在步骤a)中在溶液中产生第一组杂交探针。

9.权利要求8的方法，其中第一组杂交探针是通过第一聚合酶链式反应在步骤a)中在溶液中从所述微阵列中产生的。

10.权利要求9的方法，其中在步骤a)中通过第一聚合酶链式反应在溶液中产生的第一组杂交探针进一步通过第二聚合酶链式反应而扩增。

11.权利要求10的方法，其中第二聚合酶链式反应是不对称的，优选进一步包括在不对称聚合酶链式反应中引入特异性结合对成员。

12.权利要求5-11中任一项的方法，其中步骤b)中的第二组杂交探针是在微阵列上产生并且步骤e)发生在所述微阵列上。

13.权利要求5-11中任一项的方法，其中步骤b)中的第二组杂交探针是在溶液中产生并且步骤e)发生在溶液中。

14.权利要求13的方法，其中微阵列用于在步骤b)中在溶液中产生第二组杂交探针。

15.权利要求14的方法，其中在步骤b)中的第二组杂交探针通过在溶液中第一聚合酶链式反应从所述微阵列产生。

16.权利要求15的方法，其中在步骤b)中通过第一聚合酶链式反应在溶液中产生的第二组杂交探针进一步通过第二聚合酶链式反应而扩增。

17.权利要求16的方法，其中第二聚合酶链式反应是不对称的，优选进一步包括在不对称聚合酶链式反应中将特异性结合对成员引入已扩增杂交探针。

18.一种在包含靶核酸和非靶核酸的样品中富集靶核酸序列的方法，所述方法包括：

a)将样品施加到包含杂交探针的基底上以使所述样品与所述探针杂交，其中所述探针包含与非靶核酸序列互补的序列和与靶核酸序列互补的序列，并且其中所述与非靶核酸序列互补的序列和与靶核酸序列互补的序列位置分开，和

b)从所述探针上选择性洗脱已杂交的靶核酸序列，由此富集样品中的靶核酸序列。