[发明专利]一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术无效
申请号: | 201010622210.6 | 申请日: | 2010-12-27 |
公开(公告)号: | CN102533963A | 公开(公告)日: | 2012-07-04 |
发明(设计)人: | 江洪;江必胜;廖同兵 | 申请(专利权)人: | 北京万达因生物医学技术有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100085 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 减少 引物 二聚体 非特 异性 扩增 转录 等温 技术 | ||
1.“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其特征是借助cDNA步骤的等温扩增大量RNA产物,靶RNA加入带噬菌体启动子序列的引物,以逆转录酶催化生成第一链或两条链均带启动子的cDNA,再以噬菌体RNA聚合酶结合启动子转录大量拷贝RNA产物并循环反应大量扩增的过程,扩增产物通过特异性荧光探针检测。所述的带启动子序列的引物是指选择靶特异性的中间4-8base同序的一对引物,其5’端均加上噬菌体启动子序列,如此高度近似的一对引物存在两段相同序列,最大程度地限制了过量引物间二聚体的非特异性扩增及转录,大大提高了转录介导的恒温扩增技术可靠性。
2.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的扩增模板选择靶基因代表性序列,长100-300bp,其两端选择有4-8base互补且下游取反义链后中间4-8base同序的序列作为引物。
3.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的逆转录酶包括禽类髓母细胞瘤病毒AMV逆转录酶、鼠白血病病毒M-MuLV逆转录酶和RNase H活性失活的重组M-MuLV鼠白血病病毒逆转录酶,另加RNase H酶。
4.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的噬菌体RNA聚合酶包括T7、T3、SP6等RNA聚合酶Polymerase。
5.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的噬菌体启动子序列是指T7、T3、SP6结合识别序列。
6.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的引物设计原则是在引物距3’末端3-5base远的中间部位选取4-8base同序策略,引物3’末端不能有两个以上互补且最末一个碱基绝不能互补,引物5’端不能有三个以上互补特别是连续互补,引物5’端均加上噬菌体启动子序列。
7.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的实验条件同于一般转录介导的等温扩增技术。酶共同反应条件:pH8.5的4mMTris-CL,5mM KCL,1.2mM MgCL,0.2mM DTT和1.5%DMSO,引物浓度3-5μM。
8.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的灯标荧光探针设计原则是:探针环长16-32base,总长最好<40nt,Tm值比引物的Tm值要高5-10℃;选择的序列接近扩增产物中心,距两引物≥6base;探针锅柄区/发夹区选靶为长4-8bp互补序列以形成锅柄样结构;5’端不能是G碱基,标荧光素,3’端标淬灭剂且必须封闭。
9.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的检测方式包括便携式掌上荧光阅读仪快速即时现场检测;也可以实时荧光等温扩增分析,和通过微纳PCR芯片对多靶基因、多基因位点进行等温扩增-阵列快速检测。
10.根椐权力要求1所述的“一种减少引物二聚体非特异性扩增的转录等温扩增技术”,其所述的技术用于基因检测试剂盒,盒成份包括:核酸提取试剂,dNTPs,rNTPs,T7polymerase,逆转录酶M-MLV及其缓冲液,灯标荧光探针,带T7上游引物F/下游引物R,标准对照物,DEPC纯化水dH2O,RNasin,矿物油。
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